滨州学院图书馆的建立最早可追溯到1958年。当时，北镇师范学校升格为北镇师范专科学校，北镇师范学校图书室亦改称为北镇师范专科学校图书馆。1983年，校驻地滨县北镇改建滨州市，随之更名为滨州师范专科学校图书馆。2001年1月，滨州师范专科学校、滨州教育学院、滨州电视大学三校图书馆合并，仍命名为滨州师范专科学校图书馆。2004年学校由专科升格为本科，更名为滨州学院，图书馆遂改为现名。
孙子研究院成立于2005年9月，是全国高校第一家孙子兵法专门研究机构。它以弘扬孙子为代表的优秀传统兵学文化为宗旨，以服务地方和打造孙子文化学术品牌为核心，以孙子思想理论及其在社会领域的应用为主要研究内容，分别进行孙子其人其书、孙子兵学理论、孙子兵学文献、孙子文化普及应用及产业开发等研究。
黄河三角洲文化研究所是滨州学院2000年成立的校级科研机构，滨州市于2005年批准为副处级科研机构，2013年批准为正处级科研机构。
滨州学院继续教育学院（远程教育中心）是学校根据社会发展和学校实际，在原继续教育学院、远程教育学院的基础上于2013年12月合并新组建的教学单位，保留“滨州广播电视大学”的牌子。
教师教育学院以“博学、笃志、 切问、近思”的院训为指导，以教师教育的理论和实践研究为己任，统筹兼顾教师教育的学术性和师范性，探索新型的、开放的教师教育培养模式，提高人才培养质量，为基础教育输送“爱教、能教、乐教”的合格师资。
黄河落天入东海，诗书漫卷耀齐鲁。2015年7月，为适应高校人才培养变革与学科融合发展的时代要求，以滨州学院原中文系（始建于1958年）、历史系（始建于1984年）为基础，整合经济管理系、政法系部分专业组建而成的人文学院正式成立。
体育学院始建于1976年，2005年开始招收本科专业，生源辐射山东省各个地市。现有体育教育、舞蹈学（体育方向）两个本科专业。经过近四十年的专业建设和精心打造，形成了“文体并举、学践合一”的办学理念，专业积淀深厚、特色鲜明，为滨州市及周边地区培养体育专业人才4000多人。
滨州学院艺术学院创建于2016年8月，由原美术系和音乐系合并组建而成，现设有美术学、音乐学、舞蹈学、视觉传达设计、环境设计、数字媒体艺术6个本科专业。艺术学院秉承“知行并举、德艺双馨”的院训，借鉴国内外众多艺术院系的经验，形成了审美理论和审美实践相结合、纯艺术和实用艺术相结合、专业艺术教育和艺术素质教育相结合的办学特色。
马克思主义学院是直属学校领导的教学单位，承担着全校思想政治理论课、思想政治教育本科专业的教育教学管理工作。现有教职工55人，其中教授14人，副教授14人，专任教师中14人具有博士学位，另有2人博士在读，师资力量雄厚。学院下设综合办公室、学生科两个科室，以及8个教研室，其中3个教研室被评为校级先进教研室。
滨州学院理学院前身是滨州师专数学系，创建于1958年，是学校最早建立的院系之一。2017年10月由原数学系与航空工程学院大学物理教研室合并组建成理学院。学院现设有代数与几何、分析、数学教育、统计、高等数学和大学物理6个教研室，数学实验室和大学物理两个实验中心，开设数学与应用数学和应用统计学两个本科专业。目前在校本科生436人。
滨州学院外国语学院（大学英语教学部） 地址：山东省滨州市黄河五路391号
滨州学院经济管理学院组建于2005年。现有财务管理、市场营销、税收学、经济统计学4个本科专业，会计、市场营销、工商企业管理3个专科专业；财务管理（春季高考、金融会计方向）、市场营销（电商与网络营销方向）、市场营销（春季高考、电商与网络营销方向）3个校企合作办学本科专业，会计（金融会计方向）、市场营销（金融营销方向）2个校企合作办学专科专业，市场营销1个中外合作办学专科专业。现有全日制在校学生2036人，其中本科1376人，专科660人。
滨州学院生物与环境工程学院，现有生物科学、生物技术、食品质量与安全、设施农业科学与工程、生态学，生物制药，环境工程7个本科专业及园艺技术、药品生产技术2个专科专业，在校生900余人。现有专任教师67人，其中教授4人，博士29人，市级突出贡献专家4人。
化工与安全学院现有教职工100人，具有博士学位教师74人，省级教学名师2人，滨州市青年学术带头人4人，硕士生导师19人，滨州学院聚英计划第一层次1人，第二层次4人，第三层次8人。现有6个本科专业，2个专科专业，8个教研室，8个党支部，在校生1100余人。建有山东省工业污水资源化工程技术研究中心和化学化工山东省实验教学示范中心，仪器设备总值3000余万元。
建筑工程学院设有土木工程、建筑学、城乡规划、地理信息科学4个本科专业（2021年3月新增地理信息科学第二学位专业），建筑工程技术1个专科专业，并在土木工程、建筑学、地理信息科学专业增设机场建设、机场规划与设计、航空测绘三个航空类方向，现有教职工55人，其中博士16人（在读博士5人），硕士36人，“黄河英才”特聘教授1人，教授4人，副教授16人，5位教师入选学校中青年拔尖人才培育支持计划（“聚英计划”），在校生近1200人。
