贵州医科大学医学科学研究所为专职科研机构，目前设置有8个研究室及2个行政科室，分别为神经调控研究室、泌尿生殖医学研究室、心血管疾病研究室、重症医学研究室、再生医学研究及创伤医学研究室、神经病理研究室、脑血管疾病研究室。

贵州医科大学研究生院 地址：贵州省贵阳市云岩区北京路9号

马克思主义学院是独立设置、直属学校领导的思想政治理论课教学科研组织，前身是1955年成立的政治课教学组，1956年更名为政治课教研组，1959年更名为马列主义教研室，1989年更名为马列主义教研部，1995年更名为社会科学部，2016年更名为马克思主义学院。

贵州医科大学成人继续教育始于1985年，为适应社会发展需要，1992年11月16日成立了成人教育部，2003年11月15日改建为成人继续教育学院。

贵州医科大学外国语学院与学校80余年的历史足迹相伴相随，在发展中前行，在前行中成长、壮大。外国语学院前身为英语教研室，隶属学校基础医学部（现基础医学院），1998年从基础医学部分离出来，成立大学外语教学部，主要承担学校公共英语教学任务。2010年成立外国语教育系，与大学外语教学部合署并存，承担英语专业和全校公共英语教学任务。2014年10月，“外国语教育系（大学外语教学部）”正式更名为“外国语学院”，同年开始招收翻译专业本科学生。

基础医学院成立于1982年，前身是基础医学部，1938年本校创建之时，来自北京协和医学院的李宗恩、王志均、朱章赓、汤佩松和张昌颖等我国知名医学教育先驱开启了基础医学院的历史，也奠定了基础医学学科服务边陲健康事业的基调。历经八十载努力，学院已发展成为集教学、科研和社会服务于一体的基础医学人才培养和科学研究基地。

贵州医科大学临床医学院，前身是原国立贵阳医学院医本科。1938年随贵阳医学院的建立而诞生，是当时国内仅有的9所国立医学院校临床医学本科专业之一。

贵州医科大学药学院的前身为1938年建校之初周金黄教授建立的药理生理教学组，1973年正式成立药学系，2003年更名为贵阳医学院药学院，2015年更名为贵州医科大学药学院。1938年国立贵阳医学院成立之初，周金黄等老一辈贵医人开启了药学教育先河。

贵州医科大学公共卫生学院始建于1958年(原预防医学系)，1961年院系调整时停办，学系合并为卫生学教研室开展教学工作，1985年恢复重建并招收预防医学本科生。

贵州医科大学护理学院前身为国立贵阳医学院附设医事职业科，后改为护士学校。1999年在护士学校基础上组建护理系，2001年开始护理学本科教育，是贵州省高等学校护理学特色专业建设点、贵州省护理学专业综合改革试点、省级实验教学示范中心建设点。

贵州医科大学医学检验学院（原贵阳医学院医学检验系）创建于1986年，是全国较早建立的医学检验本科教育基地之一，历经三十年的艰苦探索和积累，贵州医科大学医学检验学院现已发展成为贵州省培养医学检验高层次人才的摇篮。

医学影像学院成立于2013年，是全国最早建立PACS的学科之一、是国家卫计委外周血管介入培训基地、省内最大的影像医学本科生和研究生培养基地、影像专业住院医师规范化培训基地。

贵州医科大学口腔医学院前身为1941年建立的贵阳医学院附属医院口腔科，由我国最早的牙医学鼻祖之一、美国加州大学牙医学博士张舒麟教授创立，是贵州省最早的口腔医学发源地。

贵州医科大学在我省较早设立生物医学工程专业（2003年）和生物技术专业（2004年）。2013年3月组建医学生物工程系。2014年正式更名为生物与工程学院。2014年成功获批化学生物学本科专业并于同年开始招生。2016年生物医学工程学科获得贵州省教育厅批准建设的重点学科（培育）。

贵州医科大学运动与健康学院成立于2012年，2009年开始招收社会体育指导与管理（户外方向）专业，是我国第2所开展户外方向本科生培养的高校；2010年省教育厅在我院加挂职教师资专业；2013年增设休闲体育专业，同年申报体育专业硕士学位授权点，2014年获得体育专业硕士一级学科授权点。