浙江农林大学动物科技学院前身是浙江林学院林业与生物技术学院的动物学科（组建于2006年）。2010年，浙江林学院更名为浙江农林大学。随着动物学科的蓬勃发展与壮大，2011年7月学校校长办公会议通过了“关于积极筹建动物科技学院”的文件。同年9月，学校聘请浙江大学方维焕教授作为筹建组负责人建设动物科技学院，随后筹建工作启动。

马克思主义学院成立于2011年4月，是统一负责全校马克思主义理论教学、学科建设、科学研究的教学科研单位。2017年学院马克思主义理论学科从硕士学位授权二级学科增列为一级学科，2018年被评为校级重点学科。现有硕士生导师12人，全日制在校研究生30人。

艺术设计学院创立于2005年，前身是1985年1月成立的园林系，2002年1月更名为园林与艺术学院，2005年4月园林与艺术学院分设为园林学院和艺术设计学院。

数学与计算机科学学院于2021年5月设立，由原信息工程学院两办（学院办公室、学生办公室）、计算机科学与技术学科及4个本科专业、信息类本科教学实验中心，和原理学院的数学学科及3个本科专业组成。

光机电工程学院设有光学工程学科、农业工程/机械工程学科和电子信息工程系，是全国首个光机电工程学院。拥有光学工程硕士学位点、机械专业学位硕士点，负责建设农业硕士农业工程与信息技术领域（农业机械化方向）、电子信息专业学位硕士点（光电信息工程领域、电子及自动化领域）。

食品与健康学院（现代粮食产业学院）源于2001年设立的食品科学与工程学科，同年食品科学与工程专业设立。2003年，中药学学科创建，中药学专业招生。2005年，食品科学与工程学科被评为校级重点学科。2009年中药学专业列为校级重点建设专业，中药学科被评为校级重点学科，食品科学与工程专业被评为省级重点建设专业。2011年食品质量与安全专业招生。

园艺科学学院办学历史可以追溯到2002年开设的园艺专业，相关专业先后依托于林业与生物技术学院（2002.09—2007.05）、农业与食品科学学院（2007.06—2021.05），2021年5月，单独组建园艺科学学院。面对新目标，开启新征程，学院将秉承“求真、敬业”的校训，发扬“坚韧不拔、不断超越”的精神，把论文写在祖国大地上，把成果用到生产实践中，培养具备生态文明意识、创新创业能力、综合素质较高的专业复合型人才。

茶学与茶文化学院于2021年6月新组建而成，办学历史可追溯到2006年成立的茶文化学院以及2013年设立的茶学专业。其中茶文化学院先后与旅游与健康学院合署（2006年--2011年）；与艺术与设计学院合署（2011年-2018年）；与文法学院合署（2018年-2021年）。茶学专业曾归属农业与食品科学学院园艺学科，深度参与了园艺学国家一流专业、首批教育部卓越农林人才培养计划专业、园艺学一级硕士点等建设工作；并与中国农业科学院茶叶研究所等国家级茶叶研究机构开展研究生的联合培养工作。

集贤学院成立于2011年，是学校在高等教育大众化背景下，为实施精英教育所建立的荣誉学院，是学校创新创业教育的实施主体，负责统筹、组织、协调和实施创新创业教育，开展大学创新创业教育研究与实践工作，兼具创新教育与创业教育双重职能。学院设有综合办公室、创新创业教研部、创业实训中心、大学生创新创业中心等机构。

浙江农林大学位于杭州市临安区、杭州城西科创大走廊的西端，是浙江省重点建设高校、浙江省人民政府与国家林业和草原局共建高校。学校创建于1958年，时称天目林学院，1966年改名为浙江林学院，2010年更名为浙江农林大学。经过60年的建设，学校已发展成为以农林、生物、环境学科为特色，涵盖八大学科门类的多科性大学，建立了学士、硕士、博士完整的人才培养和学位授权体系。

浙江农林大学继续教育学院始于1987 年，当年学校在教务处设立函授部，开展成人高等学历教育。1993年学校决定由原来的“浙江林学院教务处函授部”更名为“浙江林学院成人高等教育部”，仍隶属教务处。

浙江农林大学体军部前身是浙江林学院体育教研室，具有优良的体育传统和体育基础，2002年7月正式成立体育军训部。体军部设有2个教研室（第一、第二教研室分别管理教学、训练、群体、科研等工作），2个办公室（部办公室、军训办公室）和1个体质测试健康中心（分别处理部门日常工作、学生军训工作和学生体质健康测试工作）。部门现有教职工32人，其中行政管理人员4名，专任教师28名。专任教师中：副教授14人，讲师12人，助教2人；博士学位1人，在读博士1人，硕士学位21人。

浙江农林大学竹子研究院成立于2022年4月，是浙江农林大学为服务乡村振兴、“碳达峰碳中和”、“一带一路”等国家战略，助力浙江共同富裕示范区建设，科技赋能竹产业转型升级而成立的高水平创新平台。研究院重点开展竹资源种质创新与精准培育、竹林稳碳增汇、竹基新材料智造与竹废料高效综合利用、笋竹高值化利用等方向的应用基础研究和技术攻关，强化科研成果及时转化应用，解决竹产业发展瓶颈，致力于打造学科交叉、三产融合的研发平台和学术高地，为竹产业转型升级提供强劲科技支撑，服务竹产业高质量发展。

浙江农林大学图书馆创建于1958年，原名天目林学院图书馆。由于学校在上个世纪六、七十年代曾几度并入浙江农业大学，因而也几度改名为浙江农业大学图书馆、浙江农业大学天目分校图书馆等。1978年12月份学校重新独立办学，复名浙江林学院图书馆。2010年3月18日更名为浙江农林大学图书馆。

浙江农林大学信息与教育技术中心前身为现代教育技术中心，成立于2001年7月，由学校原网络中心、电教中心合并而成，下设信息化建设部、网络技术部、教育技术部三个部门。