山东财经大学管理科学与工程学院成立于2011年，其历史可追溯至创办于1989年的经济信息管理专业。经过三十余年的建设，学院已发展成为拥有本、硕、博完整的办学层次和国家级一流专业、省一流学科、泰山学者设岗学科、省高水平应用型重点建设专业群、省教育服务新旧动能转换专业对接产业项目、省级工程实验室、省级工程技术研究中心等综合实力较强的教学科研单位。
工商管理学院是山东财经大学历史悠久、规模较大的学院之一，历经60余年的发展，已从建校之初的商业系成长为一所师资力量雄厚、学科资源丰富、人才培养体系完备的商学院。学院是山东省一流学科、山东省高水平学科建设单位和工商管理一级学科博士点授权单位。在全国第四次学科评估中，工商管理学科获得B+的成绩，名列全国前20%。
山东财经大学会计学院目前有本科、硕士、博士三个办学层次,其中：本科分会计学、审计学、财务管理和资产评估4个专业；硕士分学术硕士和专业硕士,学术硕士有会计学、财务管理和审计学,专业硕士有会计、审计和资产评估；博士有会计理论与方法、财务管理和审计理论与方法三个研究方向。
山东财经大学公共管理学院组建于2011年,最早可追溯至原山东经济学院公共管理系（2001年）,由原山东经济学院和原山东财政学院部分院系、科研机构合并组成。
山东财经大学由山东经济学院和山东财政学院合并组建而成,是财政部、教育部、山东省共建高校,是一所办学历史悠久、财经特色鲜明、综合实力突出,在国内外有一定影响的普通高等财经院校。2013年7月,经国务院学位委员会批准,学校取得博士学位授予权,是山东省唯一具有博士学位授予权的财经类院校。
山东财经大学法学院于2011年由原山东经济学院法学院、社会发展学院部分专业和原山东财政学院政法学院合并组建而成。1983年，山东经济学院在原基础课部建立经济法教研室，1993年设立国际贸易法专业，2000年筹建法学系，并于同年招收法学本科生。2005年法学系改制为法学院。山东财政学院政法学院的前身为成立于1987年的马列主义教学研究部，1998年成立政治法律系，2002年更名为政法学院，并于同年招收法学本科生。
2011年7月，山东经济学院和山东财政学院合并组建山东财经大学。同年10月，原山东经济学院马列主义教研部和原山东财政学院思想政治理论课教研部正式合并为山东财经大学马克思主义学院。
学院于2011年10月由原山东财政学院体育教育学院和原山东经济学院体育学院合并组建而成。担负着专业教学、学科建设、科研研究、公共体育课教学、高水平运动队训练竞赛、课外群众体育活动的开展、大学生体质监测和体育场馆设施管理服务等工作。学院目前拥有1个二级学科硕士点（体育产业管理）,2个本科专业（体育经济与管理、社会体育指导与管理）,5支高水平运动队（男排、女排、男乒、女乒、男足）；拥有1个校级重点学科（体育经济与管理）、2个校级精品课程。学院目前全日制在校生600余人。
山东财经大学文学与新闻传播学院是2011年在原山东经济学院文学与艺术学院和山东财政学院人文艺术学院基础上重新组建的多学科综合性学院。
山东财经大学是财政部、教育部、山东省共建高校，学校于2011年7月由原山东经济学院和原山东财政学院合并组建。山东经济学院的前身山东财经学院，创建于1952年；山东财政学院始建于1986年，邓小平同志亲笔题写校名，是财政部与山东省人民政府共同创办的普通高等财经院校。
山东财经大学中日韩研究院成立于2020 年11月。研究院依托山东财经大学优势学科,为山东对外开放新高地建设和东北亚区域经济合作提供人才、智库和平台支撑。截至目前,中日韩研究院已获批“教育部高校国别与区域研究备案中心”“山东省外事研究与发展智库”“山东省与特定国家或区域交流合作研究中心”。
2011年,原山东经济学院和山东财政学院合并为山东财经大学。同年11月,在原山东经济学院外国语学院大学英语各教研室及原山东财政 学院外国语学院大学外语教研室的基础上单独组建公共外语教学部,承担全校本科生和研究生的公共外语教育教学任务。2016年11月,国际教育学院商务英语教研室整体并入公共外语教学部。
2022年,统计学院和数学与数量经济学院合并成立统计与数学学院。学院前身可追溯至1952年山东财经学院成立时的计划统计系。改革开放后于1980年开始招收计划统计学专业本科生,是山东财经大学最早招生的四个专业之一。现拥有统计学、数学与应用数学两个国家一流本科专业,经济统计学、金融数学和数据科学与大数据技术三个山东省一流本科专业,以及中加合作统计学本科专业。
山东财经大学计算机科学与技术学院的历史最早可追溯到1982年山东经济学院在会计系设立的计算机教研室。经过30多年的沿革发展，学院现有计算机科学与技术、数字媒体技术、人工智能三个本科工科专业，其中前两个为国家一流本科专业。
2011年，艺术学院由原山东经济学院文学与艺术学院和原山东财政学院人文艺术学院的艺术学科整合而成，是一个伴随着山东财经大学合并建校而成立的具有蓬勃朝气的新学院。1997年以来，原山东经济学院与原山东财政学院的基础部就相继成立了艺术教研室，在全校开设艺术类课程。2005年，原山东经济学院成立文学与艺术学院，原山东财政学院成立人文艺术学院，2006年，两个学院同时开始招收艺术类本科专业。
