南昌大学软件学院（以下简称学院）成立于2002年6月,是国家示范性软件学院联盟成员、江西省首批示范性软件学院。学院地处青山湖校区,该校区有着六十多年的文化积淀,环境优美,科技学术氛围浓厚,学风优良。

南昌大学食品学院源于1984年创办的原江西工业大学食品工程系和江西大学食品科学系。1987年江西工业大学成立“食品工业学院”,时任中共中央政治局常委陈云为学院题名。1993年江西大学和江西工业大学合并组建南昌大学,原江西工业大学食品工业学院与原江西大学食品科学系合并,组建南昌大学食品工业学院,1994年与生物科学工程系重组为南昌大学生命科学与食品工程学院。2014年因学科发展需要,成立食品学院。

南昌大学生命科学学院发轫于1940年创办的国立中正大学生物系,是国内开办较早的生物系科之一。

资源环境与化工学院源于1958年江西工学院化学工程系,历经时代变革与学科的多次改革发展,目前已形成了以环境与化工两大工程学科为主,以资源利用为学科研究发展方向的学科交叉、理工渗透型工科学院。目前学院现有在校生1700余人,其中全日制博士、硕士研究生约350余人,本科生1400余人。

建筑工程学院的前身主要是原江西工学院的土木建筑工程系,办学始于1940年创建的国立中正大学土木水利学科。自1958年创系后,于当年招收了第一届工业与民用建筑专业学生,次年建筑学专业开始招生,以后经历过专业下马、师生下放等变动,全系师生曾辗转萍乡、武宁、景德镇等地,办学实力大受损伤。

南昌大学江西医学院（医学部）的前身是创办于1921年的江西公立医学专门学校。1952年改名为江西省医学院。1953年更名为江西医学院。1958年,与中国人民解放军第八军医学校合并,仍称江西医学院。1969年,与江西中医学院合并,成立江西医科大学。1972年11月与江西中医学院分设,复名为江西医学院。

基础医学院前身可追溯至原江西省立医学专科学校于1934年设立的教务处基本系,历经80余年的风雨历程,目前已发展成为江西省内规模最大的基础医学人才培养与科学研究基地。

南昌大学公共卫生学院的前身为江西医学院预防医学系,曾历经两次建系。第一次建系于1959年；第二次恢复建系于1984年,并于次年招收预防医学专业首届本科生。2002年江西医学院预防医学系更名为江西医学院公共卫生学院,2005年合并组建新南昌大学后,更名为南昌大学公共卫生学院。

南昌大学药学专业于2000年7月开始招生,当时挂靠于原江西医学院基础医学部,2002年12月成立江西医学院药学系,2005年8月药理教研室及临床药理教研室由基础医学部划归药学系,并随着学校合并更名为南昌大学药学系,2012年9月更名为南昌大学药学院,2016年7月开始招收临床药学专业本科生。

南昌大学护理学院于1999年开始招收首届护理本科生,是江西省最早开办全日制护理本科教育、硕士教育的高等学校。学院经过二十年的建设发展,形成了本、硕、博较为完整的人才培养体系,拥有学术学位和专业学位硕士授权点,与澳大利亚默多克大学、泰国清迈大学建立了联合培养博士研究生项目。

江西省医学科学研究院，前身为1958年成立的中国医学科学研究院江西分院，1978年恢复重建为江西省医学科学研究所。该所秉承“科研立身、服务社会”的宗旨，长期致力于基础医学领域的研究，涌现和培养了一大批优秀的高层次医学科研人员，为江西医学科研事业做出突出贡献。积极开展国际交流与合作，成为世界卫生组织在江西信息交流定点联系单位。

南昌大学创新创业学院成立于2016年,为学校正处级直属单位,履行协调全校创新创业教育、推动创新创业教育改革等职能。学院领导班子为1名正院长(兼任教务处副处长),5名副院长(1名专职副院长,4名副院长分别由校团委、毕业生就业指导服务中心、学生工作处、科技园领导兼任)。

前湖学院是学校为进一步深化教育教学改革,充分发挥地方高水平综合性大学优势,切实培养引领区域经济和社会发展的拔尖创新人才,于2014年3月成立。学院开办综合实验班,积极探索拔尖创新人才培养机制和模式,2014年首届招收学生101人。

南昌大学图书馆是中国高等教育文献保障系统 (CALIS) 成员馆、 CALIS 江西省高校文献信息服务中心、教育部科技查新工作站（ L25 ）、江西省医学科技情报中心。

南昌大学是国家“双一流”计划世界一流学科建设高校、教育部与江西省部省合建高校、江西省国家“211工程”重点建设高校、江西省高水平大学整体建设高校。