云南农业大学工会,其前身是中国教育工会昆明农学院基层委员会,成立于1961年5月12日,1979年召开了学校首次会员代表大会。随着学校的建设发展,到2016年全校建立以院、处级为单位的基层工会委员会31个,全校在职会员达1800多人。

共青团云南农业大学委员会是云南农业大学先进青年的群众性组织，是学校共青团的领导机关。做作为党的助手和后备军，共青团组织肩负着加强广大学生的思想政治道德教育、素质拓展、校园科技文化建设、指导青年志愿者服务、指导校学生会和学生社团联合会的职能。目前，共青团云南农业大学委员会下设组织宣传部、科技实践部、文体社团部三个部室，下辖21个学院分团委。

云南农业大学图书馆始建于1958年,现为中国农学会图书馆分会理事馆、云南省高校图工委现代信息技术专业委员馆、云南省图书馆学会常务理事馆,云南省高校先进图书馆、云南省教育农学文献中心,教育部科技查新工作站。

云南农业大学档案馆自学校成立以来,直属学校党校办主管,随着学校办学规模的扩大,2017年6月档案馆成为学校处级建制单位,馆舍位于云南农业大学东苑校区耕读楼四楼。现档案馆内设综合科、综合档案科,有工作人员4名,其中硕士学历1名、本科学历2名。

云南农业大学学报编辑部 地址：云南省昆明市盘龙区金黑公路95号（东区）、云南省昆明市盘龙区沣源路452号（西区）

2012年12月,云南农业大学新农村发展研究院成立；2021年7月,依托云南农业大学成立云南省乡村振兴研究院,秘书处/办公室设在云南农业大学新农村发展研究院。本文对两院分别进行介绍。

云南省滇台特色农业产业化工程研究中心（简称“滇台中心”）成立于2012年9月,是经云南省发展与改革委员会批准的省级工程研究中心。2016年1月,与云南省科学技术院共建“滇台农业技术转移及产业化示范中心”。

云南省高原特色农业产业研究院成立于2014年4月,是依托云南农业大学管理的正厅级事业单位。核定事业编制28名,其中院长1名（正厅级,由云南农业大学校长兼任）、副院长3名（副厅级）,内设5个处室：综合办公室、财务处、项目管理处、产业发展处、专家服务处。

云南农业大学后勤集团有限公司 地址：云南省昆明市盘龙区沣源路452号云南农业大学西区逸夫楼A区101室

云南农业大学督导工作委员会办公室 地址：云南省昆明市盘龙区金黑公路95号（东区）、云南省昆明市盘龙区沣源路452号（西区）

网络管理中心是学校信息化与网络工作的归口管理部门,在云南农业大学信息化与网络安全工作领导小组的指导、监督下完成学校信息化与网络的规划、建设和组织实施。网络管理中心曾隶属于党委办公室、校长办公室,教学科研服务中心,党委宣传部。2017年4月,学校正式设立网络管理中心（由大数据学院院长兼任网络管理中心主任）,下设综合科和网络管理科,人员编制7名。

中国—东盟教育培训中心是为落实温总理提出的“中方愿意设立10个职业教育培训中心,为东盟国家经济社会发展提供所需的人力资源”的倡议,由外交部和教育部于2012年7月共同批准成立的国家级对外(主要是东盟国家)教育和培训基地,是中国面向东盟10个教育培训中心中专门培养农业相关领域人才的教育合培训基地。

云南农业大学继续教育学院主要承担学校高等学历继续教育和非学历继续教育工作。现有在职人员15人，其中教授2人，副教授5人，讲师6人。建有由校内外专家学者、云南省产业岗位专家、企业管理人员及生产一线技术人员组成的师资库。有函授学生13000余人，“十三五”累计培训基层农技人员、农村基层干部、农村致富带头人、职教师资等共计10000余人次。

农学与生物技术学院前身为始建于1938年的云南大学农学院农学系,是云南农业大学办学最早的学院。学院由4系、7所、1场、1室、1中心组成。4系是作物科学系、作物遗传育种系、生物技术与生理生化系、中药材与植物科学系；7所为稻作所、甘蔗所、薯类所、魔芋所、中草药研究所、紫苏所和食用菌研究所；1场为校内教学实验农场；1室为云南省高校作物种质创新与可持续利用重点实验室；1中心为作物学实验教学中心（云南省高等学校实验教学示范中心,云南省本科实践能力提升工程中心）。

云南农业大学动物科学技术学院创办于1950年，前身为国立云南大学农学院畜牧系，1960年设立云南畜牧兽医学院，1961年合并至昆明农林学院成立小哨分院，1964年迁至昆明农林学院本部（现址）成立畜牧兽医系，1969年搬迁至大理州宾川县，1970年迁至原曲靖地区寻甸县，1971年成立云南农业大学畜牧兽医系，1979年迁回现址。1995年成立云南农业大学动物科学技术学院。