陇南师专“陇蜀道文学与文化研究中心”前身为成立于2008年的校级学术研究机构—— “陇南方言研究中心”。为了进一步凝练学术研究方向，助力学校学科建设与科研人才培养，推动历史悠久、特色鲜明的陇蜀道文学与文化研究，提升学校服务地方经济文化建设的质量与水平，据2021年4月25日校发〔2021〕26号文件《关于调整我校研究机构和负责人的通知》要求，在学校科研外事处指导下，研究中心更名为“陇蜀道文学与文化研究中心”，依托于文学与传媒学院。
小学教育专业开办于2003年，共招收18届学生，累计招生5490名学生,目前在读学生1103人。该专业2006年通过国家毕业生质量合格验收，2008年通过国家人才培养水平评估验收，2010年被评为甘肃省特色专业。2014年获批教育部“基于‘实践取向’的卓越小学教师培养”项目计划，我校也是该项目获准立项的全国20所高等院校中唯一一所专科学校。2021年，作为甘肃省首批乡村小学全科型教师定向委托培养单位，获批招生计划110名，计划数居全省之首。
外国语学院是陇南师范高等专科学校建校之初首批成立的五个教学院系之一，现为甘肃省高等学校大学英语课程教学指导委员会及甘肃省翻译工作者协会会员单位。
继续教育学院（培训学院）是学校成人教育和各级各类培训的总实施单位，代管陇南市第五国家职业技能鉴定所、陇南市金桥职业介绍所两个法人单位，下设办公室、财务科、培训科、函授部、自考中心等5个内设机构。与兰州大学、西北师范大学、甘肃农业大学、陕西师范大学等6所高校建立了成人教育联合办学合作关系。建成兰州大学成人教育教学站、陕西师范大学函授站两个，在册成教生人数1793人。现有教职工15人，学院设院长兼任党总支书记1人、副院长1人。
陇南师专马克思主义学院成立于2016年11月，是甘肃省高职高专首家马克思主义学院，2017年5月加入甘肃省高校马克思主义学院联盟。2019年4月，加入了甘肃省高校马克思主义学院联盟陇东南分会。学校于2019年1月依托马克思主义学院成立了陇南师专习近平新时代中国特色社会主义思想研究中心， 陇南红色文化研究中心。
陇南师范高等专科学校学前教育学院源于1992年成县师范幼师中专班， 2003年9月成立教育系，2013年12月成立学前教育学院，迄今为甘肃乃至西北培养了3000多名幼儿园师资。学院现有学生1688人，35个教学班。2011年中央财政专项支持187万元建设学前教育专业，2014年被评为甘肃省高校特色专业，2017年5月，陇南市依托学前教育学院设立陇南市幼儿师资培训中心，2019年7月，学前教育专业被评为省级教学团队。
陇南师专音乐与舞蹈学院是在原音乐系基础上于2014年12月组建成立的二级学院，现有音乐教育(师范类)和舞蹈表演(非师范类)两个专业，大学专科层次。音乐教育专业于2003年开始招生，培养德智体美劳全面发展、掌握音乐学科基本理论、基础知识与基本技能、具有奉献精神和实践能力的能够适应基础教育改革和发展需要的小学音乐教师，近年来教学质量稳步提升，2017年被评为甘肃省“特色专业”。
文学与传媒学院是我校办学时间最长、综合实力最强的学院之一。现设有小学语文教育、现代文秘2个专业，其中小学语文教育是我校的传统优势专业，也是省级特色专业。
陇南师范高等专科学校数信学院成立于2014年1月，由原数学系和物信系合并而成，是全校最早设立的六个学院之一。学院设有数学教育、计算机应用技术、信息安全与管理（网络安全方向）、小学教育（科学方向）4个专业。现有各专业全日制在校学生900余人。
陇南师范高等专科学校作为一所80年办学历史的学校，服务地方经济社会发展是学校的优良传统。2015年。学校为贯彻落实甘肃省“1236”扶贫攻坚行动和陇南市委“433”发展战略，为脱贫攻坚提供人才和智力支撑，申请成立了全国西部地区第一家电子商务学院。
陇南师范高等专科学校体育与健康学院其前身是陇南师范高等专科学校体育系，始建于2005年7月，2015年12月，根据学校系改院建制，更名为体育与健康学院。
陇南师专美术与设计学院是在原陇南师专艺术系、美术系的基础上于2016年1月设立。现有美术教育、艺术设计2个专科专业。美术教育专业面向甘肃农村基础教育，以培养具有大专学历的小学美术师资为目标。艺术设计专业主要培养具有一定艺术创意与表现、设计与制作能力，能为地方社会经济发展服务的高素质技能型专业人才。
农林技术学院是以陇南师专生化系为基础，2013年12月合并陇南市农业技术学校组建的二级学院，是培养涉农类应用型人才为特色的学院。
陇南师专历史文化与旅游学院创立于2003年，后来在地理系基础上与历史教育专业合并组建而成新学院。目前学院设有历史教育专业、地理教育专业、旅游管理专业、酒店管理专业，曾开设景区开发与管理和烹饪工艺与营养专业等。新学院的组建更加突出专业特点和服务地方经济社会发展的宗旨，在学科建设与专业设置上更加强调实践应用型培养目标，是莘莘学子求学和行业人员培训进修的理想之地。
机电工程学院是学校重点建设的培养工科类应用技术型人才的学院，学院师资力量强，实习实训设施完备，教学中推行“理实一体化”教学，突出实用技能的训练。学院紧紧围绕国家和区域产业发展设置专业，现开设有物理教育、汽车检测与维修技术、供用电技术、焊接技术及自动化、应用电子技术及机电一体化技术六个专业。
