体育学院现有教职工57人（专任教师51人），其中教授6人，副教授18人，具有硕士以上学位教师24人，其中博士1人，在读博士10人，国际裁判4人，国家一级及以上裁判30余人。现有体育教育、社会体育指导与管理、冰雪运动3个本科专业。我校是全国10 所开设“冰雪运动”专业高校之一，也是自治区唯一一所开设“冰雪运动” 专业的高校。拥有室内教学训练运动场地1.61万平方米（含五人制足球场2块、八人制足球场1块，篮球场2片、羽毛球场10片、网球场2片、排球场2片、健身房2片，乒乓球台40个）；室外教学训练运动场地4.
文学院现有教职工40人（含外聘教师2人），其中教授6人，副教授14人，硕士24人，博士1人。教师中入选自治区“321”人才工程1人。教师近5年发表教学科研论文二百余篇，其中国家级和核心期刊40篇，教材及专著16部，承担国家级科研项目1项、省部级科研项目20余项。
蒙古学学院是呼伦贝尔学院最早成立的具有民族特色和地区特色的院系之一。至今已有43年的办学历史。学院成立以来，培养的“德才兼备”的少数民族本专科应用型人才。绝大多数毕业生活跃在基层农村牧区教育、文化工作第一线，还有一部分毕业生从事公务员、翻译、编辑、记者、宣传、秘书等其他相关行业的工作，大部分已成为业务骨干。其中，也涌现出一批享誉全国、自治区的知名专家、学者、作家和诗人，并有相当多的人担任了基层领导职务。
外国语学院的前身是原呼伦贝尔盟教育学院外语系，初期开设专科层次的英语专业和俄语专业，2004年招收俄语专业本科生，2005年招收英语专业本科生。学院现有本、专科两种办学层次，英语、英语（蒙）和俄语3个招生专业，分别设置了英语教育、蒙授英语、俄语、应用俄语培养方向，目前在校生近千人，共设33个教学班。学院办学40余年来，为自治区和全国各地输送了数千名中小学教师以及经贸、旅游、外事等部门亟需的应用型外语人才。
历史与民族文化学院组建于2015年6月。前身是海拉尔师专政史系，是本校建立最早的院系之一，2010年更名为政治与历史学院，2015年，历史专业与政治与历史学院分离，与呼伦贝尔学院民族历史文化研究院合二为一，现在是一套人马两个牌子，定名为历史与民族文化学院。
数学与统计学院前身是海拉尔师范专科学校数学系。1977年开始招收4年制本科生和2年制专科生。1993年组建呼伦贝尔学院数学系，开设数学教育专业。2003年升为本科，开设数学与应用数学（师范）专业。2008年更名为数学科学学院。2011年增设应用统计学专业，开始招收统计学和大数据分析方向学生，2014年更名为数学与统计学院。
物理与电子信息学院现有两个本科专业——物理学、电子信息工程。电子信息工程专业又分为三个专业方向：一是移动互联网方向，2014年7月与北京安博教育集团大连分公司签署了“3+1”模式的校企合作协议，至今有在校生（231）人。二是物联网方向，于2015年7月与北京东方智业文化发展有限责任公司实现了“3+1”模式的校企合作，至今有在校生（239）人。三是通信工程方向，于2017年7月与北京华晟经世有限责任公司实现了“3+1”模式的校企合作，至今有在校生（304）人。
化学与化工学院成立于2015年6月，是呼伦贝尔学院新建院系之一。由原生命科学与化学学院化学专业、应用化学专业以及原工程技术学院化学工程与工艺专业组建而成。学院现有3个本科专业，是一个理工兼容，协同发展的院系。化学专业2005年本科招生，应用化学专业2007年本科招生，化工工程与工艺专业2012年本科招生。学院现设有化学系、应用化学系、化学工程与工艺系和实验实训中心4个系部。
学院现有教职工24人，其中专任教师20人。专任教师中教授5人，副教授6人，高级实验师2人，讲师4；具有博士学位6人，硕士学位11人，硕博比70.8%。
机电工程学院成立于2003年，2006年开始招收本科生。现开设机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化、机械工程3个本科专业；汽车检测与维修技术、机械制造与自动化2个专科专业。学院现有教职工40人，专兼职教师33人，其中正高级职称7人，副高级职称7人，讲师14人，博士2人，硕士19人，在读博士1人。双师型教师14人。现有全日制本、专科生860人，生师比26:1。
计算机学院始建于1993年，由原海拉尔师专、呼伦贝尔管理干部学院、呼伦贝尔教育学院、内蒙古广播电视大学呼盟分校四校计算机教学部门合并而成。1993年开始招收计算机专业专科生，2003年开始招收计算机专业本科学生，是学校首批升本院系之一，截止2015年共为社会输送本专科毕业生4697人。
工程技术学院为呼伦贝尔学院下属的二级学院，2019年08月，由建筑工程学院与采矿工程专业合并而成，现有教职工36人，共开设有土木工程（含中外联合办学）、工程管理、道路与桥梁工程、采矿工程等4个本科专业，下设土木工程、工程管理、道路桥梁与渡河工程以及采矿工程四个系和一个实验实训中心。是内蒙古自治区建设类二级资质培训机构。
经济管理学院是呼伦贝尔学院规模较大的二级学院,经济管理人才培养的摇篮。学院有工商管理和应用经济学两个一级学科,五个本科专业,分别是会计学、市场营销、工商管理、国际经济与贸易、经济与金融,其中市场营销专业（互联网营销方向）是与安博教育集团共建专业。学院设有会计学、市场营销、企业管理和国际经济与贸易四个教学系和一个自治区级实验教学示范中心,即企业运营模拟实训中心。
旅游与地理学院前身是1991年设立的地理科，1993年建成地理系，1999年更名为旅游与地理系，2008年建成学院。现有地理科学、旅游管理、人文地理与城乡规划、酒店管理4个本科专业。
音乐与舞蹈学院前身音乐系始建于1996年，1997年9月正式招生。2008年更名为音乐学院，2015年更名为音乐与舞蹈学院。培养了音乐学、音乐表演(蒙古族民歌演唱)和舞蹈表演专业毕业生近2000余人。向社会各界输送合格的音乐教育、音乐表演等方面的艺术人才，为自治区及呼伦贝尔当地的经济文化建设做出了应有的贡献。
