主办：上海海洋大学党委学生工作部、学生处（学生就业创业服务中心） ；地址： 上海市浦东新区沪城环路999号（临港新城校区）、 上海市杨浦区军工路318号（军工路校区）、上海市杨浦区民星路435号（ 民星路校区）

上海海洋大学研究生教育始于1983年，经过38年的发展，目前已拥有水产、海洋科学、食品科学与工程、生物学等4个一级学科博士学位授权点，水产、海洋科学、食品科学与工程、生物学、农林经济管理、环境科学与工程、计算机科学与技术、生态学、软件工程、应用经济学、法学、外国语言文学、船舶与海洋工程、马克思主义理论等14个一级学科硕士学位授权点。

主办：上海海洋大学党委武装部（保卫处） ；地址： 上海市浦东新区沪城环路999号（临港新城校区）、 上海市杨浦区军工路318号（军工路校区）、上海市杨浦区民星路435号（ 民星路校区）

主办：中国教育工会上海海洋大学委员会（妇女工作委员会） ；地址： 上海市浦东新区沪城环路999号（临港新城校区）、 上海市杨浦区军工路318号（军工路校区）、上海市杨浦区民星路435号（ 民星路校区）

上海海洋大学教育发展基金会是为更好的服务学校教育事业发展，于2012年3月经上海市民政局、上海市社团局批准正式成立的。

发展规划与学科建设处（高教研究所、质量管理办公室）、信息化管理办公室是对学校的发展规划、高教研究和质量管理工作组织进行研究、论证和督办落实的处级行政职能部门。

主办：上海海洋大学党委教师工作部、人事处 ；地址： 上海市浦东新区沪城环路999号（临港新城校区）、 上海市杨浦区军工路318号（军工路校区）、上海市杨浦区民星路435号（ 民星路校区）

主办：上海海洋大学教务处（招生办公室、教师教学发展中心） ；地址： 上海市浦东新区沪城环路999号（临港新城校区）学生事务中心、 上海市杨浦区军工路318号（军工路校区）

主办：上海海洋大学科学技术处 ；地址： 上海市浦东新区沪城环路999号（临港新城校区）、 上海市杨浦区军工路318号（军工路校区）

上海海洋大学国际交流处（留学生工作办公室）、港澳台事务办公室是上海海洋大学行政机关负责外事（港澳台）工作的一个职能机构，是学校执行国家外交政策和教育外事政策、处理全校外事（港澳台）工作的一个归口部门。

财务与资产管理处是学校负责财务管理与国有资产管理的职能部门。学校国有资产办公室与财务处合署办公，内设六个功能中心，分别为预算管理、综合管理、会计与审核、学生事务、国有资产管理、基建管理。

招投标办公室成立于2015年11月，是学校专职负责采购工作的职能部门，是学校政府采购归口管理部门，在学校采购工作领导小组的领导下，统筹学校货物、服务和修缮工程的采购工作，为学校教学科研和行政办公提供服务。

实验室与设备管理处在校党委和校行政领导下，主要负责实验室日常技术安全管理，对物资设备类固定资产进行统一管理。

主办：上海海洋大学后勤与基建管理处、教育保障中心 ；地址： 上海市浦东新区沪城环路999号（临港新城校区）、 上海市杨浦区军工路318号（军工路校区）

主办：上海海洋大学纪委（监察专员办公室）；地址： 上海市浦东新区沪城环路999号（临港新城校区）、 上海市杨浦区军工路318号（军工路校区）