马克思主义学院是直属学院领导的二级教学机构，负责全院思想政治理论课教学科研工作和党务工作专业教育教学管理。历经副科级规格政治理论教研室、正科级规格思想政治课教学部、副处级合署办公思想政治课教学部、副处级独立设置的思想政治理论课教学部等发展阶段，2022年改设为马克思主义学院。现设有党务工作专业1个。
农林科技学院设有园林技术和园艺技术2个“3+2”本科专业，开设园林技术、园林工程技术、园艺技术、建筑工程技术和建设工程监理5个高职专业，其中国家骨干专业3个、省级特色专业2个。拥有园林技术教师教学创新团队等国家级教学团队3支，国家级人才称号名师1人、省级教学名师3人，现有教职员工59人，其中教授10人、副教授15人，建成了一支名师大师引领、具有国际视野的一流高水平双师队伍。
食品药品学院是学校重点建设的二级学院。开设食品智能加工技术、食品检验检测技术、食品质量与安全、药品生产技术、药品生物技术（与中国台湾合作办学）、生物制药技术6个专业，药品生产技术专业为潍坊市亟需建设专业。目前在校生,200余人，是一个充满生机活力和美好前景的二级学院。
机电工程学院创建于1956年，在校生2600余人，师生规模位居学校同类学院前列，迄今已培养数万名高素质技能型人才，深受用人单位和社会好评。下设潍坊市数控工程技术研究中心、潍坊市表面贴装技术重点实验室。现设有机电一体化技术、数控技术、模具设计与制造、应用电子技术（含人工智能方向）、电气自动化技术(含工业机器人方向)、机械设计与制造、无人机应用技术、电梯工程技术八个专业和两个专业方向。电气自动化技术专业群入选2019年中国特色高水平高职学校和专业建设计划。
潍坊职业学院汽车工程学院成立于2004年，现设有汽车检测与维修技术、新能源汽车技术、汽车智能技术、汽车制造与试验技术4个专业，其中，汽车制造与试验技术为国家级现代学徒制试点专业、新能源汽车技术专业为潍坊市亟需建设专业。在校生1200余名，迄今已为社会培养了7000多名高素质技术技能型人才。学院先后获得“潍坊市校企合作先进集体”“潍坊市职工职业道德建设先进集体”学院“实验实训基地建设工作奖”等荣誉称号。
信息工程学院现有在校高职学生3000余人、教师75人，拥有云计算、大数据、物联网、虚拟现实等先进教学技术设备。校外拥有实训基地6处、实习就业基地86处。学院扎根职业教育、深化教学改革，以培养“有创新精神、有就业能力、有生活品质、有发展潜能”的高素质技术技能型人才为目标，坚持“校企合作、产教融合”的办学之路，秉承“德技并修、按需定制”的人才培养理念。并先后荣获山东省高校优秀党支部、山东省五四红旗团支部、潍坊市工人先锋号等荣誉称号。
化学工程学院是潍坊职业学院重点建设的二级学院，学院成立于2003年，秉持“科学的精神、绿色的情怀”，以服务区域产业发展、打造绿色化工为宗旨，走工学结合、产教融合之路，凭借区域优势和雄厚师资，已成为山东省化工技术类高素质技术技能人才培养的重要基地之一。
国际商务学院系潍坊职业学院发展势头强劲的二级学院之一，在校生1600余人。现有正式教职工81人，近80%的教师拥有双师证。其中，副教授以上职称14人，拥有硕士学位以上人员75人。
学院现有教师95人，其中，教授5人、副教授46人，硕士以上83人；设有大数据与会计、现代物流管理、供应链运营、金融服务与管理、市场营销5个高职专业；现有全日制在校生3018人。
文化创意学院是潍坊职业学院最具艺术特色、重点发展的二级学院，设有环境艺术设计、学前教育、动漫制作技术、数字媒体艺术设计、广告设计与制作、体育运营与管理、空中乘务、人物形象设计等8个高职专业，在校生4000余人。建有山东省级精品课程《三维动画设计与制作》、《音视频编辑》2门，山东省课程思政示范课程1门，院级精品课程5门。
泰山医学院源于1891年创办的华美医院医校，1903年在华美医院医校基础上组建共合医道学堂，即后来的齐鲁大学医学院。
山东省职业卫生与职业病防治研究院（以下简称山东省职防院）始建于1959年，隶属于山东第一医科大学（山东省医学科学院），设有卫生毒理学、职业卫生学、职业病学等专业学科。全院现有职工337人，其中专业技术人员312人，具有高级专业技术职务人员52人，有博士、硕士学位人员106人。拥有国务院政府特殊津贴专家、全国优秀科技工作者、山东省有突出贡献中青年专家、山东省卫生系统中青年重点科技人才等一批高层次专业人才。
山东省寄生虫病防治研究所座落于“孔孟之乡、运河之都”的济宁市，隶属于山东第一医科大学（山东省医学科学院）。是由1950年成立的“华东军政委员会卫生部黑热病防治总所”（1953年改为“山东省黑热病防治所”）与1955年成立的“山东省丝虫病防治所”于1960年合并组成。
山东省立医院始建于1897年，迄今已有123年历史。现已发展成为集医疗、科研、教学、预防保健、指导基层为一体的大型综合性三级甲等公立医院，有中心院区和东院两个院区，年门急诊总量442万人次，年出院患者18.6万人次，手术11.7万台次。2018年，医院在复旦大学中国医院排行榜位列第46，华东区综合实力位列第14；“中国顶级医院100强”位列第28。
山东第一医科大学第一附属医院（山东省千佛山医院）成立于1960年，为山东省慈善医院。医院时值国家困难时期建院，汇集了一大批国内知名的专家学者，初期主要承担全省干部保健工作，为此后山东保健康复事业的发展奠定了坚实的基础。后几经更迭，至上世纪70年代末始成为面向社会开放的省级综合医院。
