2007年华东师范大学领导高瞻远瞩，从海内外引进一批生物医学研究方向领军人才并成立生命医学研究所，同年度生命医学研究所受上海市科委委托建设上海市细胞信号网络研究技术平台，该平台于2010年圆满完成建设并成为上海市科委研发公共服务平台的专业技术平台，为上海市乃至全国的相关领域科学研究发挥良好的技术支撑作用。

华东师范大学课程与教学研究所（以下简称“课程所”）成立于1999年，是首批教育部人文社会科学重点研究基地，2017年入选国家高校高端智库联盟首批成员。附设课程改革与政策、学校课程发展、传统文化与道德课程、教研员课程领导力发展、考试与评价改革、国际课堂分析实验室、中国课程经验国际化等7个PI团队。主办CSSCI学术刊物《全球教育展望》。

华东师范大学国际与比较教育研究所的前身，即西欧北美教育研究室，是1964年经周恩来总理指示、教育部批准在我国重点院校中最早建立的外国问题研究机构之一，以为国家教育发展提供具有国际视野的战略咨询；1980年发展成为比较教育研究所；1996年改名为国际与比较教育研究所。

高等教育研究所前身是1982年建立的高等教育研究室，时任教务长的郑启明教授任研究室主任。1985年，高等教育研究室并入教育科学研究所，作为该所四个研究室之一，同时成为全国首批设置的高等教育学硕士点；1993年设置了高等教育学博士点。1998年，高等教育研究室并入教育学系，改设高等教育研究所。

华东师范大学职业教育与成人教育研究所成立于2002年3月，由华东师范大学原职业技术教育研究所与原成人及继续教育研究所强强整合而成。

华东师范大学认知神经科学研究所成立于2008年，隶属脑功能基因组学教育部（上海）重点实验室。研究所主要研究方向为：感知、学习与记忆等脑高级认知功能的神经机制。

华东师范大学人文与社会科学研究院（简称文科院）是学校人文社会科学研究工作的管理部门， 负责全校人文社会科学研究的规划、组织、协调、管理和服务工作。业务上接受全国哲社工作办、教育部社科司、上海市委宣传部、上海市教卫党委、上海市社联等部门的指导。

上海智能教育研究院（智能教育实验室）系华东师范大学与上海市教育委员会共建研究机构，教育部与上海市教育综合改革共建重点项目。

华东师范大学医学与健康研究院成立于2020年5月23日。按校党委顶层设计，医学与健康研究院将遵循“高水平、小而精、国际化”和“院办校”的建设定位，先期发展高层次医学人才团队，“从高学段向低学段”稳步推进医学学科及医学人才培养体系的建设，坚持跨学科交流与合作，努力提升基础医学研究和关键核心技术的创新能力，为建设国际先进、国内一流、特色鲜明的医学院奠定基础。

主办：华东师范大学城市发展研究院（上海城市发展协同创新中心） ；地址： 上海市闵行区东川路500号（闵行校区）、上海市普陀区中山北路3663号（普陀校区）华东师范大学地理馆3楼

崇明生态研究院是上海高校IV类高峰学科“岛屿大气与生态”建设依托的实体，由华东师范大学牵头，协同复旦大学、上海交通大学和崇明区人民政府共同建设。

华东师范大学思勉人文高等研究院（下简称“高研院”）以二十世纪中国著名史学家吕思勉先生之名命名，传承光华大学、大夏大学的人文学术传统，循沿吕思勉、施蛰存、王元化、冯契等华东师范大学老一辈学者开创的学术之路，推进人文学科的综合性研究，探索新型的学术研究机制，凝聚、培养杰出的人文研究人才。

周边合作与发展协同创新中心系2012年9月20日由华东师范大学牵头，由北京大学和复旦大学共同参与建设的协同创新平台，并与上海国际问题研究院建立了协同关系。2013年在学校领导之下进行了重新组合，现为以华东师范大学国际关系与地区发展研究院和周边国家研究院为主共同建设的协同创新平台。

华东师范大学国际关系与地区发展研究院（SAIAS）是以国际关系与区域问题为研究方向，承担国际关系领域硕士、博士研究生培养任务的实体性高级研究院。研究院的研究侧重点为俄罗斯研究、欧盟与欧洲国家研究、大洋洲研究、中亚研究、日本研究、两岸关系研究，以及与之相关的大国关系、跨大西洋关系、社会转型、国际关系理论与思想史研究等领域。

主办：华东师范大学教育高等研究院 ；地址： 上海市闵行区东川路500号（闵行校区）、上海市普陀区中山北路3663号（普陀校区）华东师范大学内 文科大楼17楼(近金沙江路)