马克思主义学院下设思想政治教育系、思想政治理论课教学部、思想文化研究所、社会化问题研究应用科普基地（省级社科普及基地）、习近平新时代中国特色社会主义思想研究中心，承担着全校的思想政治理论课教学与研究工作以及思想政治教育专业本科生培养工作。
人文学院下设中文系、英语系、秘书学系、历史系、新闻传播系5个教学机构和商洛文化暨贾平凹研究中心、英语基础教育研究所2个研究机构，贾平凹先生亲自兼任商洛文化暨贾平凹研究中心主任，12位博士倾心研究商洛地方文化。著名作家陈敏入选“陕西省文学艺术创作百人计划”，作品荣获全国小小说“金麻雀奖”。
数学与计算机应用学院的前身为成立于1976年的陕西省商洛地区五七师范学院数学科和1999年的商洛师范专科学校计算机系，2014年由商洛学院数学与计算科学系和商洛学院计算机科学系合并组建为商洛学院数学与计算机应用学院。
电子信息与电气工程学院创办于1976年，其前身是商洛师范专科学校物理系，2014年3月成立二级学院更名为电子信息与电气工程学院。学院下设物理系（大学物理教研部）、电子信息工程系、电子信息科学系、电气工程系、人工智能系5个教学机构，省级大学物理实验示范中心、省级电气工程及其自动化虚拟仿真实验中心，“三电”实验中心、电气自动化实验中心4个教辅机构。
电子信息与电气工程学院创办于1976年，其前身是商洛师范专科学校物理系，2014年3月成立二级学院更名为电子信息与电气工程学院。学院下设物理系（大学物理教研部）、电子信息工程系、电子信息科学系、电气工程系、人工智能系5个教学机构，省级大学物理实验示范中心、省级电气工程及其自动化虚拟仿真实验中心，“三电”实验中心、电气自动化实验中心4个教辅机构。
化学工程与现代材料学院前身是1980年设立的陕西师范大学商洛专修科化学科。1984年，学校更名为商洛师范专科学校，化学科改名化学系。2006年，商洛师范专科学校升格为商洛学院，化学系更名为化学与化学工程系。2014年更名为化学工程与现代材料学院。四十年来，为国家培养了5000余名化学、材料、资源循环方面的专门人才。
生物医药与食品工程学院前身为1984年成立的商洛师范专科学校农学系，2004年设立商洛师范专科学校生物医药工程系，2006年随学校升本更名为商洛学院生物医药工程系，2014年3月组建成立商洛学院生物医药与食品工程学院（简称生物学院）。
城乡规划与建筑工程学院成立于2014年3月，前身为2008年成立的城乡发展与管理工程系。学院现有地理科学、工程管理、土木工程和城乡规划等四个本科专业，面向全国28个省市（自治区）招生，现有在校学生1195人。
城乡规划与建筑工程学院成立于2014年3月，前身为2008年成立的城乡发展与管理工程系。学院现有地理科学、工程管理、土木工程和城乡规划等四个本科专业，面向全国28个省市（自治区）招生，现有在校学生1195人。
经济管理学院现设会计学、信息管理与信息系统、文化产业管理、电子商务、财务管理等5个本科专业，全日制在校本科学生1523人。教师中具有高级职称者占43.19%，具有硕士、博士学位者占95.2%，其中硕士生导师3人。长期聘请西安交通大学王能民教授、魏玮教授、西北大学吴泷教授等为学院兼职教授。
经济管理学院现设会计学、信息管理与信息系统、文化产业管理、电子商务、财务管理等5个本科专业，全日制在校本科学生1523人。教师中具有高级职称者占43.19%，具有硕士、博士学位者占95.2%，其中硕士生导师3人。长期聘请西安交通大学王能民教授、魏玮教授、西北大学吴泷教授等为学院兼职教授。
艺术学院前身是1990年建立的商洛师范专科学校美术系，2014年更名为艺术学院。学院下设有美术系、音乐系、学前教育系、公共艺术教育教研部4个教学机构和书画临摹创作中心、音乐专业训练中心、艺术作品展示中心、张村校区艺术创作基地4个教辅机构。目前，学院开设有美术学、音乐学、学前教育三个本科专业，其中，美术学获批陕西省“一流专业”。
健康管理学院是商洛学院为深入贯彻落实党中央“健康中国”战略，引领、服务地方大健康产业发展，整合校内相关学科专业资源，于2017年6月组建成立的创新型学院。旨在为地方大健康产业发展培养专业基础扎实、实践能力强，善于独立思考，富有创新和开放意识的新时代、高素质、应用型人才，以满足区域经济发展对健康管理类专业人才的需求。
健康管理学院是商洛学院为深入贯彻落实党中央“健康中国”战略，引领、服务地方大健康产业发展，整合校内相关学科专业资源，于2017年6月组建成立的创新型学院。旨在为地方大健康产业发展培养专业基础扎实、实践能力强，善于独立思考，富有创新和开放意识的新时代、高素质、应用型人才，以满足区域经济发展对健康管理类专业人才的需求。
商洛学院是教育部批准、陕西省政府举办的全日制普通本科院校，坐落于秦楚文化交汇地、革命老区、中国当代著名作家贾平凹故乡——商洛市。商洛市位于陕西省东南部，地处秦岭南麓，距离省会城市西安110公里，东临河南，东南接湖北，地跨长江黄河两大流域，兼容秦雄楚秀，历史文化源远流长，气候温和四季分明，交通区位优越便捷，生态旅游和物产资源丰富，享有“秦岭最美是商洛”“中国气候康养之都”之美誉。
