重庆理工大学应用技术学院是重庆理工大学下属的二十个二级教学单位之一，举办全日制普通高等教育应用技术本科层次教育，是学校应用型本科人才培养改革实验区。学院下设学院办公室、教务部、实践教学中心、学生工作办公室等四个科室。学院现有在职在岗职工17人，拥有一支专职的班导师队伍，在校本科学生1600余人。

重庆理工大学继续教育学院、高等教育自学考试办公室是学校下属二级教学及教学管理机构，下设学院办公室、学生工作（团总支）办公室、成教部、自考部、培训部等。其主要职责是归口管理学校的成人高等学历继续教育、高等教育自学考试、非学历教育培训等工作，分别在花溪校区和两江校区办公。

车辆工程学院始终坚持“立足西南、面向全国、服务重庆市地方经济发展”的战略方针，以“产教融合、研教一体、校企协同育人”为特色，采取开放的办学思路和创新的人才培养机制，长期与行业知名企业开展紧密型产学研合作和人才联合培养，在节能、新能源及智能汽车试验技术、汽车主被动安全、车身空气动力学、先进动力系统匹配与控制、节能与新能源动力系统开发等方面形成了鲜明特色和优势。

重庆理工大学管理学院始建于1986年，目前拥有管理科学与工程、重庆市重点学科工商管理两个一级学科硕士学位授权点，下设有企业管理、技术经济及管理、旅游管理3个二级学科硕士学位授权点，并在工商管理学科和公共管理学科下开设有9个本科专业，同时还承担学校的工商管理硕士（MBA）教育工作任务。管理学院是重庆市委组织部、重庆市经济和信息化委员会、重庆市国有资产监督管理委员会等政府部门定点的工商管理干部培训基地。学院设有企业管理研究中心、工业品营销研究中心、低碳能源研究中心、管理培训EDP中心等研究机构和培训机构。

机械工程学院的前身系1944年建校初期设立的枪械专业，是学校历史最悠久的学院之一。2020年，学校工程科学学科首次进入ESI全球排名前1%，标志着该学科已进入国际高水平学科行列。经过几代机械人的不懈奋斗，今天的机械工程学院已形成自己独特的学科优势和办学风格。学院秉承“明德笃行，自强日新”的优良校训及“自强不息,求实创新”的重理工精神，坚持“博学创新、知行合一”的学院文化，以创新、发展为主题，以学科建设为主线，坚持走育人为本、产学研用深度融合、培养高素质应用型人才的办学思路，为国家和地方经济发展培养优秀人才

重庆理工大学材料科学与工程学院成立于2001年，是重庆理工大学“博士点建设工程”重点学科单位，学院所在的材料科学与工程学科是重庆市“一流学科”立项建设学科、重庆市“十三五”和“十四五”重点学科，2011年获得一级学科硕士学位授权点，并拥有材料与化工专业学位硕士授予权，2022年进入材料学科ESI全球排名前1%。

电气与电子工程学院源于1985年的机电工程系，1992年后先后更名调整为电子信息工程系、电子信息与自动化学院、电气与电子工程学院，是学校办学历史悠久、综合实力领先，社会影响较大的学院之一。学院现有专任教师118人，其中教授24人，副教授44人，硕士生导师39人。拥有全国优秀教师、重庆市学术技术带头人、重庆市学术技术后备带头人、重庆市优秀青年骨干教师10人。

重庆理工大学计算机科学与工程学院，拥有国家级特色专业、重庆市“三特行动计划”专业计算机科学与技术、重庆市特色专业信息管理与信息系统、网络工程和物联网工程四个专业系，同时学院建有计算机基础教研室和计算机实验教学中心。现有计算机科学与技术一级学科硕士点、计算机技术领域工程硕士点。硕士点的主要研究方向包括数字图像处理与分析、网络与信息安全、物联网技术及应用、计算智能及应用、数据管理技术及应等5个方向。目前，在校全日制本科生2200余人，硕士研究生近500人。

重庆理工大学药学与生物工程学院是一个团结奋进、发展快速、充满朝气与生机的二级学院。秉持“创新驱动 产教融合 协同育人 服务健康”的办学理念，致力于国家和地方战略性新兴产业生物医药领域的知识创新、技术创新和具有一定国际视野的高层次、应用型人才培养。

重庆理工大学化学化工学院溯源于2002年学校成立的生物工程学院，2009年独立设院开启了学院快速发展的新序幕，现已成为成渝及中西部地区重要的化工人才培养基地和创新高地。

重庆理工大学理学院源于1985年成立的原重庆工业管理学院基础部，1986年调整为基础科学系，2003年更名为数理学院，2009年拆分为数学与统计学院、光电信息学院。2016年5月学校机构调整成立理学院。

重庆理工大学会计学院成立于1993年，学院设有会计系、财务管理系、审计系、会计信息化系和国际合作部（国际会计资格教育认证中心）、MPAcc教育中心、教学质量管理中心7个教学机构，设有学院办公室、学生工作办公室、研究生工作办公室3个管理机构。现有会计学、财务管理、审计学3个本科专业，设有ACCA、CIMA两个特色本科专业方向和会计信息化综合改革实验班；拥有会计学、会计专业硕士（MPAcc）、审计专业硕士（Maud）3个硕士点。全院在校学生2500余人，其中本科生1800余人，研究生近800人。

经济金融学院秉持“立德树人、开放发展”的办院理念，在人才培养、科学研究、社会服务、留学生教育等各项工作中取得了显著进步，得到了社会的认同。

重庆理工大学马克思主义学院成立于2016年7月，其前身是重庆理工大学思想政治教育学院，为学校直属的二级教学科研机构，是学校历史较悠久的院系之一。学院现有马克思主义基本原理概论教研室、毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论教研室、中国近现代史纲要教研室、思想道德修养与法律基础教研室、形势与政策教研室、研究生教育中心和学院办公室七个三级机构，重庆市中国特色社会主义理论体系研究中心重庆理工大学分中心、国学研究所和西部国情研究中心三个研究基地，以及“马克思主义理论”一级学科硕士点一个。

学院在本科层面设置了知识产权、社会工作、电子商务及法律三个专业，同时在硕士层面设置了知识产权管理硕士点以及工商管理硕士（MBA）知识产权与科技管理方向。学院充分发挥与实务界的良好合作关系，构建了产教融合协同育人体系，以订单式培养，嵌入式教学，移动课堂，服务学习等多种模式培养高素质实务人才。