复旦大学电磁波信息科学教育部重点实验室由金亚秋院士创立，现任实验室主任为信息学院徐丰教授，依托良好的电磁信息领域研究基础，实验室面向国家战略，结合新工科学科建设，致力建设国际先进、国内领先的空天电磁信息科学基础研究实验室。近年来，团队成员研究成果丰硕，累计获得多项国家级及省部级奖项。

主办：复旦大学非线性数学模型与方法教育部重点实验室 ；地址： 上海市杨浦区邯郸路220号(邯郸校区)

主办：复旦大学教育部先进涂料工程研究中心 ；地址： 上海市杨浦区邯郸路220号(邯郸校区)复旦大学先进材料楼5楼

主办：上海市现代应用数学重点实验室 ；地址： 上海市杨浦区邯郸路220号(邯郸校区)

主办：上海市分子催化与功能材料重点实验室 ；地址： 上海市杨浦区淞沪路2005号(江湾校区) 复旦大学先进材料实验室

主办：上海市大气颗粒物污染防治重点实验室 ；地址： 上海市杨浦区邯郸路220号(邯郸校区)

上海市数据科学重点实验室（Shanghai Key Laboratory of Data Science）是数据科学领域首个政府支持的重点实验室，2013年9月6日由上海市科委批准筹建。实验室总体目标是发展成为国际数据科学研究的重要研究场所和数据科学人才培养基地，引领数据科学研究。

主办：上海市针灸机制和穴位功能重点实验室 ；地址： 上海市杨浦区邯郸路220号(邯郸校区)

主办：上海工业菌株工程技术研究中心 ；地址： 上海市杨浦区淞沪路2005号(江湾校区)

主办：上海重要产品追溯工程技术研究中心 ；地址： 上海市杨浦区邯郸路220号(邯郸校区)遗传楼三楼

主办：复旦大学生物多样性与生态工程教育部重点实验室 ；地址： 上海市杨浦区淞沪路2005号(江湾校区)生命科学院大楼G区

遗传与发育协同创新中心（以下简称“中心”）是贯彻落实教育部、财政部《关于实施高等学校创新能力提升计划的意见》（简称“2011计划”）重要精神，于2012年9月在复旦大学揭牌成立的非法人独立学术研究机构。

主办：复旦大学遗传工程国家重点实验室 ；地址： 上海市杨浦区邯郸路220号(邯郸校区)复旦大学遗传楼

主办：复旦大学医学神经生物学国家重点实验室 ；地址： 上海市徐汇区东安路131号(枫林校区)-东区

主办：复旦大学医学分子病毒学重点实验室 ；地址： 上海市徐汇区东安路131号 复旦大学枫林校区复星楼（科研1号楼）