闽南师范大学是福建省重点建设高校、福建省“双一流”建设高校，成立于1958年春。1963年，在周恩来总理亲自倡导和关怀下，国务院批准成立福建第二师范学院，由此开启我校本科教育之扉。1986年经原国家教委批准复办福建第二师范学院，并更名为漳州师范学院。
闽南师范大学文学院，前身为漳州师范学院中国语言文学系，是闽南师范大学历史最悠久、办学实力最雄厚的院系之一。其历史可追溯到1958年创建的龙溪师范学校大专班中文科。其后历经变迁，1963年改建为福建第二师范学院中文系，1986年复建为漳州师范学院中文系。2013年6月成立闽南师范大学文学院。
外国语学院是闽南师范大学最早成立、也是招生最热门的院系之一。外语学科经历了60年的积淀和发展，从最初的英语大专班到目前的4个专业、2个硕士点、本硕学生1300余人，从最早的几位教师到如今的150余名教职员工，其中教授7人、副教授41人、博士19人。无论是教育部的多轮评估还是专业认证，均获得专家的高度评价。
法学院其前身是创办于1958年福建第二师范学院的政治教育系，2002年5月成立政治法律系，2014年1月改为法学院。2015年12月，社会工作和劳动与社会保障专业并入法学院，并更名为法学与公共管理学院。2020年6月更名回法学院。目前，学院设有法学、政治学与行政学、社会工作3个本科专业，1个马克思主义法学硕士研究方向，1个社会工作专业硕士点，现有本科生1100多人，研究生42人，留学生1人。
数学与统计学院伴随学校的发展走过了六十余年的历程，是学校办学历史最长、综合实力最强的学院之一。学院现有教职工84人，其中专任教师69人中，具有博士学位的教师53人；有教授28人，副教授21人，博士生导师7人，福建省教学名师2人;国家有突出贡献的中青年专家1人、国务院政府特殊津贴专家4人、教育部高等学校数学类专业教指委委员1人，省重点学科带头人1人、闽江学者特聘教授2人、省杰青1人、省“雏鹰计划”青年拔尖人才1人。先后聘请中国工程院院士1人为学院讲座教授，7位国内知名教授、4位外籍教授为我院闽江学者讲座教授
闽南师范大学是福建省重点建设高校，成立于1958年春。1963年，在周恩来总理亲自倡导和关怀下，国务院批准成立福建第二师范学院，由此开启我校本科教育之扉。1986年经原国家教委批准复办福建第二师范学院，并更名为漳州师范学院。物理与信息工程学院物理专业是1958年创校首批招生的专业之一，1988年招收首届物理学(师范)专业本科生，2001年招收首届电子信息科学与技术专业本科生。
化学化工与环境学院原名化学系，创办于1977年，1989年招收首届本科生，拥有1个一级学科硕士学位授予点（化学）、2个二级教育硕士培养方向（学科教学化学、科学与技术教育）和资源与环境专业硕士点。2017年化学与环境学科群获批福建省高原学科立项建设，同时获批成为福建省一级学科博士点建设培育单位。拥有化学、科学教育、应用化学、环境科学、环境工程、环境科学与工程、化学工程与工业生物工程七个专业。化学专业荣获国家级一流专业（原为国家级特色专业），应用化学专业和科学教育专业荣获省级一流专业。
闽南师范大学历史地理学院是福建省省属重点高校闽南师范大学下属二级学院，1996年创建历史系，设有历史学本科和专科专业各1个。2018年4月更名为历史地理学院。先后创办了旅游高职专业、旅游管理本科专业、社会工作本科专业、人文教育本科专业（师范类）、劳动与社会保障专业、文化产业管理专业等专业，为学校的专业建设做出了突出贡献。
闽南师范大学计算机学科起步较早，1981年在高庆狮院士指导下学校组建了软件研究室，组织一批教师与中国科学院计算技术研究所合作，从事微型机汉字系统等项目研究，并参与了863项目子课题《智能型英汉机器翻译系统IMT/EC-863》的研究，获得了多项省市科技进步奖，奠定了学科发展的坚实基础。
闽南师范大学坐落在国家历史文化名城、国家闽南文化生态保护区、中国“田园都市、生态之城”漳州市，是福建省重点建设高校、福建省一流学科建设高校。目前，学校正以“建设新闽师”为主题主线，朝着“东南亚知名、特色鲜明、多学科融合发展的高水平师范大学”的奋斗目标阔步迈进。学校现有北江滨校区和圆山校区两个校区，分别地处九龙江畔、圆山麓下，校园风景优美，四季如春。教育科学学院位于主校区东区，欣赏着凤凰花开、木棉飘絮的柔美和壮丽；见证着莘莘学子负笈求学来、傲然追梦去，年年岁岁。
闽南师范大学体育学院前身是漳州师范学院体育系，2001年建系，2013年系改院，现设二系一部,即体育教育系、社会体育指导与管理系、大学体育教学部。学院遵循厚基础、宽口径、重实践、强技能的培养原则，强化本科教学的中心地位，注重通识教育与专业培养相融合、理论教学与实践教学相融合、课程体系建设与社会需求相融合，培养能够胜任中小学体育教学与训练、服务社会体育的专门人才。
闽南师范大学生物科学与技术学院由生物科学系、园艺系、风景园林系、食品科学系、菌物产业工程技术中心等部门组成，前身为创建于2002年的漳州师范学院生物科学与技术系。学院现有生物科学（师范）、园艺、风景园林、园林、食品科学与工程、食品质量与安全、食品营养与健康7个本科专业和生物科学、园艺、食品科学与工程、食品质量与安全4个第二学士学位专业；有学科教学（生物）、化学生物学、风景园林3个硕士点，现有全日制普通本科生1460人，硕士研究生49人，各类成人教育学生100多人。
闽南师范大学艺术学院于2004年筹建并于2006年11月正式成立。我院坚持发展音乐、美术师范教育等传统优势专业，培育发展公共艺术等新兴专业，积极扩大校际交流，推动闽台合作办学，引进台湾博士11人；以社会需求为基础，以特色专业为主导的办学定位，坚持走“协调发展、结构合理、特色突出、优势互补”的综合发展道路。
新闻传播学院的前身是2007年成立的新闻传播系，是我校在2013年成功更名为闽南师范大学后首批组建的二级学院之一。
闽南师范大学商学院以原经济学院和管理学院为主体，在整合原历史与社会发展学院、海外教育学院部分专业的基础上于2015年2月成立。其前身可以追溯到2002年创办的经济学院和管理学院。学院根植闽南，立足福建，面向全国，加大学科建设力度，凝练学术研究方向，不断深化教育教学改革，创新人才培养模式，提升办学层次和办学质量。
