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北华大学基础医学院位于北华大学东校区，前身为北华大学医学院基础医学部。学院目前设基础医学理论教学中心、基础医学实验教学中心和基础医学研究中心。基础医学理论教学中心包括人体解剖与组织胚胎学、生理学、病理学与病理生理学、生物化学与分子生物学、细胞生物学、免疫学、病原生物学、生物医学工程和医学人文9个学科；基础医学实验教学中心包括医学形态学、医学机能学、医学分子、病原生物学和生物医学工程5个实验部；医学基础研究中心包括医学形态学、医学机能学、蛋白组学和病原生物学4个研究室。
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