审计处在经历多次的合并分立后，于2016年开始单独成立沈阳农业大学审计处。审计处在学校党政的领导下，依法独立开展内部审计，对学校内部的财政财务收支活动实施综合性经济监督。审计处对校长负责和报告工作。审计业务接受国家审计机关和教育部审计机构的业务指导。
沈阳农业大学学生处（党委学生工作部、武装部）是学校党委、校行政领导下主管学生工作的职能部门。始终坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为引领，牢牢把握坚决贯彻中央要求，牢牢把握紧密结合学校实际，立足“四个服务”，以立德树人为核心，以传承红色基因为主线，深入推进思想政治教育与党的教育方针相融合、与学校事业发展相融合、与专业教育体系相融合、与学生成长需求相融合，全面促进大学生成长成才，全力培养又红又专、德才兼备、全面发展的中国特色社会主义建设者和接班人。
沈阳农业大学学生创新创业与就业指导处作为处级建制的常设机构负责全校本科、硕、博毕业生就业指导服务工作以及大学生创新创业工作。成立多年来，在校党委的正确领导与大力支持下，我处以立德树人为根本，以学生需求为核心， 以提高质量为重点，积极引导学生树立“志在四方、深入基层、造福人民”的职业价值观，大力推进毕业生多渠道就业创业，努力实现毕业生更高质量和更充分就业。为沈阳农业大学人才培养及科技成果转化服务，竭力提升内涵质量建设，全力提高管理服务水平，全力完成沈阳农业大学教育目标，为建设强盛沈农，办人民满意大学而努力前
人事处（党委教师工作部、教师发展中心）是在学校党委和行政领导下，负责实施人事宏观管理与服务的职能部门。秉承“服务学校事业发展，服务广大教职员工”的工作宗旨，围绕学校重点工作，致力于建立以师资人才为核心的总量适度、结构优化、效率显著的人才队伍。具体从事宏观配置人力资源，招聘优秀人才，实施岗位聘用，开展教师培养与培训，教师发展与服务，落实薪酬与社保福利政策，提供人事综合服务等工作。
沈阳农业大学人才工作办公室 地址:辽宁省沈阳市沈河区东陵路120号
教务处是承担学校本科教育教学组织、管理和服务工作的职能部门。下设教学运行与教材科、实践教学科、专业建设与质量监控科、考务与学籍科、办公室等机构。主要围绕学校本科生人才培养方案开展专业建设、课程建设、教材建设、实验室建设、教学团队建设、实践基地建设、教学组织运行、考务学籍管理、教学质量监控、教学改革创新、教学成果培育等方面的管理和服务工作。
沈阳农业大学科学技术发展研究院 地址:辽宁省沈阳市沈河区东陵路120号
沈阳农业大学坐落于东北区域性中心城市——沈阳，是一所地方与中央共建的全国重点大学。沈阳农业大学历史可以追溯到1902年，1952年全国高等院校调整，与复旦大学农学院合并组建成了新的沈阳农学院。1979年10月经国务院批准为全国重点高等院校，1985年10月，更名为沈阳农业大学，邓小平同志亲自为学校题写了校名。今天的沈阳农业大学已成为教学和科研并举，以农业与生命科学为特色，农、理、工、经、管、法多学科协调发展的教学研究型大学。
财务处现有员工25人，下设会计核算一科、会计核算二科、综合管理科、校园卡管理科四个科室。
在学校国有资产管理委员会监督和指导下，制定学校国有资产管理办法，并组织实施；负责资产的清查、登记、统计报表及监督检查；负责全校固定资产报废、报损、调拨、出借、捐赠等资产处置的申请受理、鉴定、评估、审核及处置工作；负责全校仪器设备及家具的入账审核及账、卡、物管理工作；负责常规教学仪器设备维修工作，负责组织采购物资的验收工作。
公安保卫处是学校安全保卫工作的职能机构，下设侦调秘书科、治安科和消防科三个科室。
沈阳农业大学乡村振兴战略研究院成立于2018年5月。2020年1月，为深入贯彻落实习近平新时代中国特色社会主义思想和党的十九大精神，充分发挥学校在助力国家、地方实施乡村振兴战略中的作用，经学校党委研究决定，将原乡村振兴战略研究院与新农村发展研究院合并，重新组建了沈阳农业大学乡村振兴战略研究院，作为学校直属科研机构和服务乡村振兴战略的议事协调机构。
2018年6月，原网络中心与现代教育技术中心合并成立沈阳农业大学现代教育信息中心。中心历史可以追溯到1979年的电教中心，拍摄的电教教材有三部获农业部电影电视“神农奖”，多部电教教材获得不同级别的“优秀电教教材”奖。2001年电教中心更名为现代教育技术中心。网络中心成立于2001年，负责全校的网络硬件、软件等建设与管理工作。
沈阳农业大学档案馆2018年6月成立，副处级建制。由原党政办公室综合档案室和人事处人事档案室合并而成，档案馆下设办公室。历史可以追溯到1956年人事处成立人事档案科，1960年建立的文书档案室，1982年成立科技档案室，1987年成立综合档案室。
沈阳农业大学海城创新创业示范中心（沈阳农业大学农作物生产综合实验实训中心、实习实训基地、大学生创新创业基地、新农村发展研究院海城研究院）（简称海城基地）由海城市政府负责投资建设，沈阳农业大学负责学校运营。该项目于2014年10月1日开工建设，2017年4月份投入试运行。
