党办校办（审计处）是学校党政日常办事机构，发挥着参谋助手、督促检查、综合协调的作用，承担着服务领导、服务部门、基层和师生的职责；负责学校财务预、决算及国有资产和重点、热点问题的审计工作。党办校办现设秘书科、综合科、督查科、调研信访科；挂靠单位有收发室、计生办；审计处内设工程审计科、财务审计科。

校纪委在省纪委和校党委的双重领导下开展工作，加强对二级单位纪检工作的领导；监察专员办公室根据授权认真履行监察职责。校纪委与派驻监察专员办公室合署办公，主要职责是：

1.坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，持续深化“三转”，聚焦主责主业，全面履行党章赋予的“监督、执纪、问责”职责；根据省监委授权，履行“监督、调查、处置”职责。

江西农业大学教务处是学校全日制普通本科教学工作的行政主管部门，主要的职能是组织学校全日制本科日常教学管理和教学运行工作，贯彻执行上级教育行政部门的教育教学管理政策，制定我校本科教育教学的总体发展规划，提出学校本科教学改革的方案和措施，拟订并组织执行学校教学工作规章制度、人才培养方案和教学工作计划，开展教育教学研究，组织协调创新创业教育工作以及完成上级领导交给的其他任务。

江西农业大学组织部 地址：江西省南昌市昌北经开区志敏大道1101号

党委宣传部是学校党委主管意识形态方面工作的职能部门，是社会主义精神文明建设的牵头协调部门。

江西农业大学人事处 地址：江西省南昌市昌北经开区志敏大道1101号

江西农业大学财务处是学校的一个职能部门，可追溯于江西共产主义劳动大学总校1960年设立行政处下的计财科，当时共6人。1963年8月设立生产财务处，下设生产、计划财务2个科，共21人。1963年9月，设立计财处；1964年，计财处并入行政处。1965年恢复计财处。文革期间计财处并入总务处的会计组。

党委统战部是党委主管统一战线工作的职能部门，承担了解情况、掌握政策，协调关系、安排人士、增进共识、加强团结等职责。工作范围主要包括各民主党派成员，无党派人士，党外知识分子，出国和归国留学人员，少数民族人士，有宗教信仰的人士，港澳同胞及在高校就读的港澳学生，台湾同胞及其亲属（包括在大陆定居的台胞和就读的台湾学生），海外侨胞和归侨侨眷等。重点是专业领域成果显著、组织上有代表性、社会上有影响的党外人士。

1987年10月，经中共江西省直属机关委员会批准，成立中共江西农业大学机关总支部委员会，1998年更名为中共江西农业大学机关委员会，简称江西农大机关党委。江西农业大学机关党委是在学校党委领导下的党的二级党组织，设书记一名（由分管校领导兼任），常务副书记（正处级）一名，副书记（副处级）一名，委员若干名，专职秘书1名。2015年10月，机关党委与组织部、党校合署办公，简称部（委、校）。

江西农业大学科技处 地址：江西省南昌市昌北经开区志敏大道1101号

研究生院（研究生工作部、MPA教育中心）是学校主管研究生工作的职能部门，负责研究生的招生、培养管理、学位授予、思想政治教育等方面的工作。

江西农业大学学生工作部（处）（简称：学工部（处））是全校大学生思想政治教育和行政管理的职能部门。

江西农业大学保卫处（综治办、稳定办），现有在职保卫干部22人，聘用人员51人。设处长1人，副处长2人，内设“四科一会一中心”，分别是政保科、治安秩序科、综治消防科、东区保卫科、居委会及校园110指挥中心，分别由1名干部负责。

资产与实验室管理处是学校国有资产管理和实验室管理的职能部门。

国际交流处（港澳台事务办公室）是学校涉及外事及港澳台事务的职能部门。