肇庆医学高等专科学校鼎湖校区综合办公室 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
肇庆医学高等专科学校就业指导办公室、实习办公室 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
肇庆医学高等专科学校校长办公室 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
肇庆医学高等专科学校中职部 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
肇庆医学高等专科学校武装部 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
肇庆医学高等专科学校党委办公室 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
肇庆医学高等专科学校纪检监察处 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
共青团肇庆医学高等专科学校委员会 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
肇庆医学高等专科学校工会 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
肇庆医学高等专科学校图书馆 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
信息中心由原教务处教育技术中心、公共基础部计算机教研室并入网络教学中心组成的学校二级教辅部门，负责统筹学校信息化建设和管理工作。
肇庆医学高等专科学校实验中心 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
肇庆医学高等专科学校继续教育学院 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
马克思主义学院是学校成立的直属学校党委领导的二级教学和管理机构。下设“毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论”、“思想道德与法治”和“军事理论课”三个教研室。
肇庆医学高等专科学校人文学院 地址： 广东省肇庆市西江南路6号 （端州校区）、 广东省肇庆市鼎湖区新城北18区团结路1号 （鼎湖校区）、广东省肇庆市鼎湖区莲花镇富廊新村丰乐路12号（新区校区）
