福州大学数学与统计学院的前身为福州大学数学力学系，成立于1958年福州大学创建之初。1962年数学力学系更名为数学系；1977年设置应用数学、计算数学、计算机软件、计算机技术专业；1984年由数学系相关专业和师资组建了计算机科学与技术系；2003年6月，为坚持理工结合的办学特色、促进基础学科和应用学科融合发展，数学系和计算机科学与技术系合并成立了数学与计算机科学学院。
福州大学石油化工学院成立于2014年2月27日，由福州大学、泉州市泉港区人民政府、福建石化集团公司共同建设，在福州大学旗山校区、泉港校区、怡山校区等三个校区办学。
土木工程学院的前身为土木建筑工程系，成立于1958年。1998年8月，福州大学以土木建筑工程系为主成立土木建筑工程学院，2006年5月，分设建筑学院后，更名为土木工程学院。
环境与安全工程学院延续2003年成立的环境与资源学院，是办学历史悠久、学科优化发展、不断接续奋进的学院。追溯其历程，经历了矿冶系（福州大学1958年创办时仅有的五个系之一）、地质采矿工程系、资源工程系、环境与资源工程系、环境与资源学院、环境与安全工程学院等发展阶段。
福州大学经济与管理学院主体位于福州大学主校区旗山校区，地处旗山脚下、乌龙江畔；其专业学位教育及高端培训中心位于闽江之滨的怡山校区，与千年古刹西禅寺毗邻。校园风景优美，四季如春。
福州大学生物科学与工程学院创建于1978年，经过40多年的发展，特别是通过国家“211工程”、国家“双一流”建设高校和福建省“一流”学科的建设，在食品科学与工程、生物工程和生物医学工程等学科专业已形成鲜明的特色和优势，成为培养福建省乃至全国生物工程、食品科学与工程和生物医学工程专业技术人才的重要基地。
学院成立于2003年，其前身是1958年成立的外语教研室以及1981年成立的外语系。1978年招收英语专业专科生，1982年开始招收英语专业本科生，2001年获批英语语言文学硕士点，2002年设置日语专业本科，2005年设置德语专业本科，2010年获批外国语言文学一级学科硕士点、外国语言学及应用语言学硕士点和翻译专业硕士学位点。
福州大学计算机与大数据学院/软件学院的前身为福州大学数学力学系，成立于1958年福州大学创建之时。1962年改名数学系。1977年设置应用数学、计算数学、计算机软件、计算机技术专业。1982年成立计算机科学系。2003年6月，为进一步秉承理工结合的办学特色，促进基础学科和应用学科互动发展，两系合并成立了数学与计算机科学学院。2009年10月，数学与计算机科学学院和软件学院进行实质性整合。2021年5月，为了适应当前学科发展的需求，撤销数学与计算机科学学院，成立了计算机与大数据学院。
学院成立于2003年，由原信息与通信工程系和电子科学与应用物理系合并而成。两个系的前身分别为无线电工程系和物理学系，均为福州大学建校初期设立，已有60年办学历史。学院在旗山校区拥有1栋办公大楼和2栋实验大楼，在怡山校区和福州软件园分别拥有1栋科研大楼，公共用房总面积超过3万平方米，科研与教学实验仪器设备总值超过1亿元。
福州大学微电子学院前身为微电子学专业，于1970年开始招生，为福建省培养出第一批微电子学专业人才，1972年开始面向全国招收微电子专业学生，1999年根据教育部大类招生目录改为电子科学与技术专业微电子（器件）方向招生。为促进中国集成电路（IC）产业的发展，加速福建省集成电路专业技术人才的培养，促进闽台两岸IC产业对接和为海峡西岸创新经济建设提供有力的人才支撑，福州大学从2005级复办微电子学本科专业，从2009级开始进行微电子学专业卓越工程师培养，并且依托福建省集成电路设计中心，建立起集教学、研发与产业化
福州大学化学学院的前身——化学系，由著名化学家、原全国人大副委员长、中科院院长卢嘉锡先生在1958年福州大学成立之初创建，是福州大学设置最早的系之一。1961年化学系与同期建立的化工系合并为化学化工系。1984年由化学化工系又分立成化学系和化工系。2001年5月两系合并组建为化学化工学院。2014年3月从化学化工学院再次拆分为化学学院和石油化工学院。
建筑与城乡规划学院前身为建筑学专业，创办于1989年，1993年建筑学专业学制改为5年，1998年成立建筑系，2003年创办城市规划专业，学制5年。2006年在建筑系的基础上创办建筑学院，2012年创办风景园林专业，学制5年，2019年学院更名为建筑与城乡规划学院。
福州大学紫金矿业学院成立于2007年6月6日，由福州大学与紫金矿业集团股份有限公司合作创办，是一所重点以培养高层次地矿专门人才的全日制本科生和研究生学历学位教育为主的新型学院。学院成立了由校企双方代表组成的理事会，紫金矿业集团股份有限公司陈景河董事长任理事会理事长，福州大学黄志刚副校长任理事会副理事长。
福州大学是国家“双一流”建设高校、国家“211工程”重点建设大学、福建省人民政府与国家教育部共建高校、福建省人民政府与国家国防科技工业局共建高校，现已发展成为一所以工为主、理工结合，理、工、经、管、文、法、艺等多学科协调发展的重点大学。
福州大学材料科学与工程学院成立于1998年6月，2017年被列入福州大学世界一流学科群建设。学院现有2个教学系，2个本科专业（其中材料科学与工程专业为教育部首批一流本科专业），拥有省级实验教学示范中心、省级重点实验室、省级工程研究中心、省级公共服务平台和省级技术开发基地。
