校人民武装部在校党委、行政和上级军事部门、教育部门的领导下进行工作。学生工作处是在学校党委和行政领导下负责全校学生思想政治教育、行为规范管理、帮困助学、心理健康教育等工作的协调和管理部门。学生工作部是负责全校学生教育、管理的职能部门。
共青团兰州交通大学委员会是中国共产党兰州交通大学委员会领导的先进青年的群众性组织，担负着服务学校发展建设、团结教育全校广大青年的重要任务。校团委下设组织部、宣传部、办公室、社会实践部、科技创新部、大学生素质拓展中心、大学生创业培训中心。日常指导：学生会、研究生会、学生社团联合会、青年志愿者协会、大学生艺术团、青年传媒中心。
兰州交通大学国有资产管理处 地址：兰州市安宁区安宁西路88号
实验管理中心是我校实验室规划与建设、实验教学和实验室安全的统一归口管理部门。在主管副校长领导下，按照《高等学校实验室工作规程》等上级部门有关规定和要求，组织制定适应学科建设要求的实验室发展规划、建设计划及仪器设备购置计划，建立和完善有关规章制度，积极推进实验室建设、实验教学及仪器设备管理的制度化、规范化和科学化。积极推进实验教学改革，努力构建工程复合型人才所需要的实验教学人才培养体系，切实保障实验教学的完成，促进实验室社会服务和技术开发工作的开展，保障实验室安全。
兰州交通大学校友会是由兰州交通大学和兰州交通大学海内外校友自愿发起成立，经甘肃省教育厅审查、并经省民政厅社团登记管理机关核准登记注册的学术性、行业性、地方性、非营利性社会团体。
兰州交通大学保卫处 地址：兰州市安宁区安宁西路88号
兰州交通大学离退休工作处 地址：兰州市安宁区安宁西路88号
兰州交通大学图书馆始建于1958年，经四次（改、扩）建，图书馆总建筑面积49463平方米，馆设11个藏、借、阅一体的图书文献库，7个书刊阅览室，学术报告厅等，可向全校师生提供3300余个阅览座位。图书馆的建设和发展与学校的建设和发展相适应，已成为学校文献信息资源中心，是甘肃省五大文献收藏单位之一。
兰州交通大学学报编辑部 地址：兰州市安宁区安宁西路88号
兰州交通大学网络信息中心（2018年5月由现代信息技术与教育中心更名为网络信息中心）于2000年4月在原计算中心（1979－2000）的基础上组建。网络信息中心为处级建制，由主管校长直接领导。
兰州交通大学招标中心经2019年9月25日校党委常委会会议研究决定成立，设主任1名，副主任1名。下设综合管理科、招标管理科、采购管理科。招标中心的成立，将进一步规范招标与采购行为，提高招标与采购工作管理水平和资金使用效益，维护学校合法利益，促进廉政建设。
四电BIM工程与智能应用铁路行业重点实验室（Key Laboratory of Railway Industry of BIM Engineering and Intelligent Applicationfor Electric Power, Traction Power Supply, Communication and Signaling）于2020年12月获国家铁路局批准成立，是首批铁路行业科技 创新基地之一，也是兰州交通大学首个铁路行业重点实验室。共建单位有甘青公司、黔常张公司、中铁五院、中铁建
甘肃省道路桥梁与地下工程重点实验室是甘肃省科技厅2007年立项、依托兰州交通大学建设的省级重点实验室。
兰州交通大学机电技术研究所是专业从事铁路、交通和航空机场物流系统及信息化建设的产学研一体化高科技研究和工程项目设计的专业机构。机电技术研究所以兰州交通大学为科研依托，与深圳中集天达空港股份有限公司、宁东铁路股份有限公司等大型企业合作，与甘肃省物流及运输装备信息化工程技术研究中心、甘肃省物流与信息技术研究院等单位组成产学研合作联盟，充分利用高校资源及人才优势，在铁路机务信息化、机车车辆检修过程质量监控、民航机场货运信息化监控管理、现代物流系统监控、自动化立体车/仓库、企业信息化管理、网络工程等领域开发出多项
自动控制研究所（简称“自控所”）成立于1997年，是我校建立的第一个校直属正处级科研单位。自控所同时是“甘肃省工业交通自动化工程技术研究中心”和“甘肃省轨道交通信号与控制评测行业技术中心”的依托单位，具有从轨道交通信号控制机理、智能仿真、信号系统到自动测试完整的学科分布和优势领域。二十多年来，自控所为我国轨道交通建设、科技发展和人才培养做出了重要贡献。
