湖北中医药大学纪委监察专员办公室 地址：湖北省武汉市洪山区黄家湖西路16号（黄家湖校区）、地址 ： 湖北省武汉市洪山区黄家湖西路1号（黄家湖医院）、湖北省武汉市武昌区昙华林特一号（昙华林校区）

学生工作部（处）是学校党委和行政执行学生教育管理职责的职能部门，下设综合办公室(档案室)、学生教育管理科、学生资助管理中心、学生心理健康教育中心、招生办公室、学生就业指导中心。

湖北中医药大学工会 地址：湖北省武汉市洪山区黄家湖西路16号（黄家湖校区）、地址 ： 湖北省武汉市洪山区黄家湖西路1号（黄家湖医院）、湖北省武汉市武昌区昙华林特一号（昙华林校区）

共青团湖北中医药大学委员会是湖北中医药大学先进青年的群众性组织，作为党的助手和后备军，担负着团结和教育广大青年学生，执行党的青年工作方针，创造性地开展工作的职能。

湖北中医药大学发展规划处（学科办、目标办） 地址：湖北省武汉市洪山区黄家湖西路16号（黄家湖校区）、地址 ： 湖北省武汉市洪山区黄家湖西路1号（黄家湖医院）、湖北省武汉市武昌区昙华林特一号（昙华林校区）

湖北中医药大学人事处 地址：湖北省武汉市洪山区黄家湖西路16号（黄家湖校区）、地址 ： 湖北省武汉市洪山区黄家湖西路1号（黄家湖医院）、湖北省武汉市武昌区昙华林特一号（昙华林校区）

教务处是在校长和主管教学副校长领导下的有关本科教学工作的主管职能部门，下设综合科、教务科、质监科、学籍科、实习科、教材科。

湖北中医药大学国有资产与设备管理处 地址：湖北省武汉市洪山区黄家湖西路16号（黄家湖校区）、地址 ： 湖北省武汉市洪山区黄家湖西路1号（黄家湖医院）、湖北省武汉市武昌区昙华林特一号（昙华林校区）

湖北中医药大学科学技术处（科协办） 地址：湖北省武汉市洪山区黄家湖西路16号（黄家湖校区）、地址 ： 湖北省武汉市洪山区黄家湖西路1号（黄家湖医院）、湖北省武汉市武昌区昙华林特一号（昙华林校区）

湖北中医药大学研究生处（学位办） 地址：湖北省武汉市洪山区黄家湖西路16号（黄家湖校区）、地址 ： 湖北省武汉市洪山区黄家湖西路1号（黄家湖医院）、湖北省武汉市武昌区昙华林特一号（昙华林校区）

湖北中医药大学审计处是在校长及分管校领导直接领导下，负责对校内所经济活动进行审计监督、评价的行政职能部门，对校领导负责并报告工作，同时接受国家审计机关和上级主管部门内部审计机构的指导和监督。

湖北中医药大学财务处 地址：湖北省武汉市洪山区黄家湖西路16号（黄家湖校区）、地址 ： 湖北省武汉市洪山区黄家湖西路1号（黄家湖医院）、湖北省武汉市武昌区昙华林特一号（昙华林校区）

学校国际交流与合作处（港澳台事务办公室）、国际教育学院主要负责学校国际交流与和合作、国际学生（含港澳台生）招生、培养与管理及港澳台事务等工作，现有正式教职工12人，设有留学生招生与管理科、外事科、港澳台事务科、教学管理科、学生管理科及综合办公室等科室。

湖北中医药大学保卫处、武装部 地址：湖北省武汉市洪山区黄家湖西路16号（黄家湖校区）、地址 ： 湖北省武汉市洪山区黄家湖西路1号（黄家湖医院）、湖北省武汉市武昌区昙华林特一号（昙华林校区）

离退休工作处是在学校党委、行政领导下负责学校离退休工作的党政职能部门，是学校离退休工作领导小组的办事机构。下设综合科、离退休科。现有在编工作人员8人，合同工2人。截止2021年底，全校离退休教职工1923人（其中学校760人、附属省中医院1163人），离休人员39人（其中学校12人、附属省中医院27人），退休人员1884人（其中学校748人、附属省中医院1136人）。