星火有机硅产业研究中心于2018年12月在九江市，九江学院主要领导的关心支持下，依托省工程中心有机硅团队成立。瞄准有机硅产业重大关键共性问题，以项目、技术为纽带，积极联合九江相关企业开展关键技术攻关，促进成果转化，为九江有机硅产业发展提供技术支撑。

九江学院柬埔寨研究中心于2017年5月成立，同年获批教育部“国别和区域研究备案中心”，前身是九江学院柬埔寨历史文化研究中心，是国内较早从事柬埔寨国别研究的机构之一。中心宗旨是建设成为一个学科综合、队伍一流、管理先进的集学术研究、人才培养、政策咨询、国际交流为一体的柬埔寨国别研究机构，以学术服务于国家外交、地方建设及学校发展。

江西省材料表面再制造工程技术研究中心（Jiangxi Province Engineering Research of Materials Surface Enhancing & Remanufacturing），2014年10月由江西省科学技术厅批准依托九江学院组建，九江市科学技术局主管。实验室由热喷涂实验室、粉末冶金实验室和先进材料及连接实验室三部分构成，中心总面积1635平方米，各类大型仪器设备126台套，设备总值1992.3万元。

九江学院社会系统学研究中心的前身是创立于2006年的社会系统学研究所，2012年2月获批江西省高等学校人文社科重点研究基地。社会系统学研究中心有专职人员5人、校内外专兼职研究员30余人，其中教授28、博士16人，博士研究生导师6人、硕士研究生导师5人。

“沿江产业开发研究中心”于2008年9月16日成立，旨在策应九江沿江开发战略，积极响应市委市政府“四个对接”号召，落实为地方经济、社会服务的责任，提升九江学院科技创新的软实力，搭建九江沿江产业研发平台和校企对接的桥梁，为九江市沿江产业与高等教育的协调发展作出贡献。通过中心的建设和发展，达到对接一批项目，构建一个科研网络，造就一只科研队伍，为地方经济培养一批人才，争出一批成果，服务一批企业。

氢作为一种清洁燃料，被视为化石燃料良好的替代品，氢燃料电池噪声低、无振动、使用寿命长、对环境无污染，且制氢原料来源广泛。在国际上，当前燃料电池市场的霸主是日本与美国，德国与韩国也占据着领先地位。我国氢燃料电池与国际先进水平差距较大，可靠性、冷启动、功率特性等主要技术性指标还存在很大差距，现有专利对核心技术的涉及较少，关键材料和器件基本不具备产业化的能力，所以目前对于氢燃料电池的研究既是挑战，也是无限的机遇。

江西省生态化工工程技术研究中心依托九江学院，以九江市功能有机分子制备与应用重点实验室为主体，联合“流域管理与生态保护”博士后科研工作站、九江学院应用化学研究所、九江学院精细化工研究所、九江学院环境保护研究所等共同组建江西省生态化工工程技术研究中心。2014年11 月由江西省科技厅批准建设。

认知科学与跨学科研究中心是九江学院2017年申报、组建的江西省省级重点科研基地，现有办公室一间，研究员室一间，多功能厅一间，总面积大约90平米。其中，多功能厅集合了图书阅览室、会议室和接待室等功能，办公设备齐全。中心网络推广形式多样，目前有自己的网站、融媒体和微信公众号等平台，可以有效进行网络发布和在线互动。

九江学院临床医学院/附属医院始建于1877年，前身是法籍天主教神父董若望创建的“圣味增爵医院”，为江西省第一所西医院，西医由此传入九江。现已发展成为拥有完善的基础设施和雄厚的医疗技术服务水平、学科设置齐全、师资力量雄厚、人才资源丰富的江西省综合三级甲等直属教学医院。

九江学院附属口腔医院/九江市口腔医院为九江市市直七家公立医院之一，是一所集临床、教学、科研、预防保健于一体的公立三级口腔专科医院，也是本科院校附属医院。历史可溯源至上个世纪五十年代。通过几代口腔人的努力，历经60多年艰苦卓绝的奋斗，医院的医疗规模不断扩大，诊疗技术不断提高，设施设备日益完善，专家团队实力雄厚。2013年经教育部批准开始面向全国招收口腔专业本科生，2015年被国家卫健委确认为国家级口腔全科住培基地，2016年被市卫健委确定为市口腔医学质量控制中心挂靠单位。

九江学院第二附属医院始建于2020年9月，2022年被写入江西省政府工作报告，是全市十大民生实事项目之一。作为九江市委、市政府卫生健康“4321”工程项目，医院以“国内一流、省内领先、百姓满意”的三甲综合医院为建设目标，将于2022年10月在九江城南区域建成一所园林化、智慧化的三级综合性教学医院，承担市城南区域及周边地区的临床医疗、医学急救、公共卫生应急及康养等服务职能。

马克思主义学院前身为“两课”教学部，是直属学校领导的、独立设置的二级教学科研机构。学院设有办公室、教学科研科两个行政科室；设有德育、马克思主义中国化、马克思主义基本原理、中国近现代史纲要、形势与政策、四史、习近平新时代中国特色社会主义思想概论等七个教研室；江西省高校人文社会科学重点研究基地“九江学院社会系统学研究中心” 挂靠在马克思主义学院。

国际交流学院（Faculty of International Studies,FIS）是九江学院直属二级学院之一，是学校开展外国留学生教育教学、国际合作项目、国际合作交流和涉外语言培训工作的业务机构。其主要任务包括各类来华留学生的招收、教学和管理，各类中外合作办学项目的管理，承办涉外培训项目和出国留学语言培训等。国际交流学院下设综合办公室、教学管理科、学生管理科3个行政科室，另设留学生汉语教研室，负责留学生的汉语教学工作。

继续教育学院是九江学院专门从事统筹、管理、组织和协调全校继续教育工作的二级学院。负责组织开展成人学历教育，归口管理学校非学历教育培训，下设办公室、招生办、学生科、教务科、函授站管理科、培训办等六个职能科室。

外国语学院由原九江财经高等专科学校、九江师范高等专科学校、九江医学高等专科学校、九江教育学院的外语系于2004年7月合并组建，现为江西省外语学会副会长单位、江西省比较文学学会副会长单位、江西省翻译协会理事单位。