保卫处是在学校党委领导下，在省教育厅及公安机关的业务指导下，负责维护学校的政治稳定、校园安全管理及师生户政服务的职能部门。

长春中医药大学审计处 地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

长春中医药大学计划财务处 地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

长春中医药大学离退休工作处（老干部办公室） 地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

长春中医药大学学位与研究生教育始于1985年，1998年获准开展在职人员以研究生毕业同等学力申请硕士学位工作，2000年获准开展临床医学硕士学位试点工作，2003年学校成为博士学位授权单位，2004年获准开展高校教师在职攻读硕士学位工作，2009年获准设立博士后科研流动站。经过近40年发展，现已形成了硕士、博士、博士后多种层次、多种类别的高层次中医药人才培养体系。

人事处是学校人力资源管理和人才队伍建设的职能处室。设处长1人，副处长1人，下设人事调配科、师资与专业技术职务管理科、工资管理科、劳动与保险科、高层次人才管理科。

长春中医药大学教务处（教师发展中心） 地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

长春中医药大学科研处（科协办公室） 地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

长春中医药大学国际交流与合作处（港澳台事务办公室、 国际教育学院）地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

长春中医药大学党委学生工作部（处）、武装部 地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

长春中医药大学党委组织部（组织员办公室、党校） 地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

长春中医药大学党委宣传部、教师工作部（精神文明办公室、文化艺术教育中心）地址：吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

长春中医药大学党委办公室、校长办公室 地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

长春中医药大学纪检监察综合办公室、监督检查（审查调查）室、审理室 地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号

共青团长春中医药大学委员会 地址： 吉林省长春市净月国家高新技术产业开发区博硕路1035号