实践教学处成立于2018年3月，是学校教学基地管理职能部门，在学校院长和教学副院长领导下，协助教务处和二级学院（部）对各教学基地下达教学任务，并协助各教学基地落实下达的教学任务。实践教学处的主要工作职责是：负责校外实践教学基地建设，负责校外实践教学的宏观管理和统筹协调；负责实践教学基地教学及其质量保障体系建设，组织督导工作；协同学校相关职能部门开展基地师资队伍建设、教学活动开展和学生管理等方面的工作。

西安医学院科研处是学校科学研究、科技发展和科技推广的主管职能部门,下设科研计划管理办公室,科研成果管理办公室,学报编辑部。

研究生处成立于2011年，是应“服务国家特殊需求人才培养项目”需求而成立，并于当年开始招生。招生对象为5年制临床医学专业本科学生，招生性质为临床医学硕士专业学位研究生。研究生处主要负责研究生从招生到就业的全部过程和我校学科建设的管理工作。

发展规划处成立于2012年4月，设有综合科和规划科，处长1人，科长2人，教育数据专职管理1人，干事1人。

人事处是负责学校人才管理与服务、教师队伍建设与发展、人事劳资工作的行政职能部门。在校党委和行政的领导下,贯彻落实党和国家人事人才工作的方针、政策，制定学校人事管理和人才工作的规章制度，统筹安排教师职业发展，开展人事人才工作研究，为学校事业发展提供人力资源保障。

我校2013年10月成立教师发展中心，与人事处合署办公开展工作。2017年10月教师发展中心和教务处教学质量评价科合并成立教师发展与教学评价中心（简称“教发评中心”）。2021年4月正式更名为“教师教学发展中心”（简称“教发中心”），正处级建制，下设“综合科”和“培训科”两个科室，中心现有工作人员6名，教学沙龙室4间，交流活动室4间。

财务处是学校财会工作的职能部门,在院长的直接领导下,组织和管理学校的各项财务收支的经济活动。现有工作人员16人，其中中高级职称9人。

西安医学院资产设备处 地址：陕西省西安市碑林区含光北路74号 （含光校区）、陕西省西安市雁塔区二环南路西段168号 （高新校区）、陕西省西安市未央区辛王路1号（未央校区）

招标与采购处（以下简称招采处）是校党政会议决定于2019年4月12日成立，是学校采购与招标领导小组的下设处室，在其领导下工作，专职负责校采购与招标管理的职能部门，统筹负责学校货物、服务、工程采购与招标工作。

西安医学院审计处是独立设置的处级内部审计机构，在学校行政主要负责人和协管校领导的领导下，依据国家法律、法规及学校的规章制度，按照审计署《内部审计工作规定》、教育部《教育系统内部审计工作规定》，认真履行中国内部审计准则和教育审计规范，独立开展内部审计业务， 通过对学校财务收支、经济活动、内部控制、风险管理实施独立、客观的监督、评价和建议，并提供咨询服务，旨在促进学校管理持续地优化和改善，提高资源利用效益，完善风险控制和提高防范风险的能力，发挥内部审计的建设性作用，促进学校各项事业健康发展。

西安医学院学院招生与就业工作处是在学校党委和行政的领导下，负责学校全日制普通本科生招生和就业创业指导与服务工作的职能部门。目前，设有招生办公室、就业指导中心、校友工作办公室三个科室。作为学校的窗口单位，招生与就业工作处坚持“以学生为本”，“一切为了学生”的服务理念，把“服务、质量、效率、创新、和谐”作为全体工作人员的工作守则。

国际合作与交流办公室/港澳台事务办公室是西安医学院执行涉外政策、协调国际合作与交流事务的职能部门和办事机构。

西安医学院后勤保障处于2007年，在学校后勤管理体制和运行机制进行调整后，由学校后勤管理处和后勤服务公司职能合并，成立后勤保障处，作为学校后勤保障管理的职能部门，代表学校对全校后勤保障工作行使全面管理职能。

西安医学院保卫处是在学校党委、行政领导下，依据国家有关法律法规和学校规章制度，维护学校政治稳定和治安安定，并为广大师生员工教学、科研、生活和学习提供安全服务的职能部门，接受上级公安机关及相关主管部门业务指导。

基建处是在院党委和行政的领导下负责管理学院基本建设的行政职能部门，下设综合科、工程科和预决算科三个科室。基建处的主要职能是制定学校总体规划和校园建设规划,并进行实施。在建设筹备阶段,负责组织编写新建项目的立项和可行性报告,根据新建项目及在建工程进展情况,编制年度基建投资计划,并组织实施和落实。