北大附中深圳南山分校创建于2000年5月，是北京大学、香港科技大学和深圳市政府三方合作的深港产学研基地的基础教育发展项目，是深圳市南山区教育局和北京为明教育集团联合创办的集小学、初中、高中、国际高中为一体的实行小班化教学的寄宿制国有民办学校。

百旺学校创办于2003年，是一所全日制、九年制教育的公益民办学校，它的开办极大地缓解了西丽片区外来务工子女入学难的问题，为政府分了忧，解了难。几年来，百旺学校以提供平等教育为目的，以向社会提供优质服务为宗旨，认真贯彻党和国家的教育方针，积极推进素质教育，制定了“依法治校、以德育人、构建和谐、强化管理、质量立校、提升品位、夯实义教双基、培养四有新人”的办学方针，以“团结、务实、创新、奋进”为校训，努力构建学习型校园。

深圳市南山区仁智实验小学是经深圳市南山区教育局批准、于2016年11月挂牌的民办非营利全日制小学，并于2017年11月通过了广东省义务教育标准化督导评估，成为国家义务教育标准化学校。

深圳市南山中英文学校是1999年建立的。她位于著名的华侨城风景区，毗邻“世界之窗”，交通便利，环境优美，占地面积接近三万平方米，校内的建筑面积大约4万平方米。

深圳道尔顿新华公学，是南山区优质教育发展项目。由乒乓球世界冠军陈新华先生、广东省创新人才促进会会长王木辉先生、庄跃南先生创办，深圳市十佳校长、市兼职督学、市人大代表梅连生担任创校校长。管理团队和教师队伍由中方特级教师、学科骨干教师、外籍优秀教师、留学海归教师、专业特聘教师组成。

深圳市华侨城小学是一所办学品质卓越的公立学校，广东省一级学校，广东省教育现代化示范学校。其创办于1980年，位于美丽的深圳湾畔，苍翠的燕晗山下,相邻OCT生态广场，坐落在全国著名的华侨城生态园区，有“森林学校”之美誉。

松坪第二小学成立于2005年8月，位于深圳市南山区高新科技园北区科苑中路与朗山二路交汇处。目前教职工73人，专任教师64人，小学高级教师26人，中学高级教师5人，特级教师1人。校园占地面积10144平方米，建筑面积8766平方米，教育教学设施设备按国家教育规范化学校标准配置，学校办学条件一流，拥有功能强大的网络平台，能满足开展现代化教育的各项需要。

深圳市南山区桃源小学（Shenzhen Nanshan Taoyuan Primary School)创办于1998年。学校位于深圳市南山区桃源社区内，占地面积15939平方米，建筑面积7952平方米。学校教育教学设备设施齐备先进，有标准200米塑胶跑道运动场1个、各种功能场室84间。

月亮湾小学座落于大、小南山之间，前海与蛇口自贸区的连接带，环境优美，自然条件优越。学校占地面积13243平方米，现有教职工92名，是一支充满活力、师德高尚、素质优良的教师队伍。

向南小学创办于1937年，先后经历了祠堂私塾、集体村办、国家办学三个发展阶段。学校在1995年评为区一级学校，1999年评为市一级学校，2004年评为广东省现代教育技术实验学校、北京师范大学现代教育技术研究所试验学校，2005年评为广东省一级学校、广东省现代教育技术优秀实验学校。

深圳市南山区地处特区西南部，与香港隔海相望，一桥相连。境内的前海自贸区是中国（广东）自由贸易试验区的一部分。自贸区兼具法制建设与行政服务、网络信息与科技服务、金融开放与信息服务、国际贸易与港口物流、供应链管理与高端航运服务等重要功能，是21世纪海上丝绸之路核心枢纽和重要门户。

南头城小学坐落在美丽的中山公园旁著名的南头古城中，学校前身是清代的“凤岗书院”，至今有200多年的历史，是深圳市历史最悠久的学校。学校先后用名“新安县凤岗书院”、“新安县凤岗小学堂”、“宝安县立第一高等小学”、“宝安县莲城小学”、“宝安县九街小学”，1985年学校更名为“深圳市南山区南头城小学”，2017年校内侨房拆除、2018年学校拆除重建，2021年2月上级部门规划为九年一贯制学校，2021年9月更名为深圳市南山区南头城学校。

深圳市南山区前海港湾小学于2015年9月1日正式开学。

北京师范大学南山附属学校是由北京师范大学和深圳市南山区人民政府按照“国有联办、委托管理、自主办学”的模式，于2000年合作创办的一所十二年一贯制的现代化公立学校，是北京师范大学在京外举办的第一批附属学校。北师大和南山区对学校的发展非常重视，拟成立学校管委会推动学校更快、更好发展，由北师大主管附校工作的副校长和南山区主管教育的副区长担任管委会的主任。

华侨城中学成立于1981年。三十多年来，学校同深圳经济特区一起成长，走过了一段由规模发展到特色发展、内涵发展的辉煌历程，成为一所办学理念先进、办学特色鲜明、教学质量优良、办学效益显著，在社会享有盛誉的优质学校。