科研实验中心是校级科研仪器平台和技术支撑机构，是我校人才培养、学科建设、科技创新及实现“双一流”战略目标的重要突破口与保障，主要负责生物医药科研大楼、大型仪器共享平台和实验技术队伍的建设与管理，并建立和完善相关管理体制、运行机制等工作。
浙江省流域水环境与健康风险研究重点实验室于2015年成立，实验室依托温州医科大学公共卫生与管理学院，着眼于生态环境与人群健康的相互关系。围绕环境污染和健康风险均呈现流域化这一特征，以流域水循环基本原理和EGIS技术为核心，以先进的环境监测、环境工程和环境评价技术为支撑，整合环境信息学、环境化学、环境工程学、生态学、生物地球化学、分析化学、生物化学、细胞生物学、预防医学等学科力量，从细胞、个体、种群到生态系统多层次综合研究流域水环境问题及其健康风险。
温州医科大学是浙江省省属普通高等学校，是教育部、国家卫生计生委和浙江省政府共建高校。1958 年8 月由从杭州分迁至温州建立，当年就开始招收五年制本科学生，以属地命名为温州医学院，2013年更名为温州医科大学，是全国首批硕士学位授予单位，具有博士学位授予权。
实验动物中心作为学校教学和科研的技术平台，近几年，学校各级领导非常重视实验动物中心的建设。2006年6月份被浙江省实验动物公共服务平台吸收为首批成员单位，2007年5月份升格为浙江省实验动物公共服务平台的核心单位，同时承担地市级动物实验基地的建设项目,2009年8月成浙江省卫生厅医学实验动物与动物实验培训基地的五个基地之一
温州医科大学生物学实验教学中心的前身可追溯至1980年建立的温州医科大学基础部生物学实验室、组织胚胎学实验室、生物化学实验室、微生物学实验室、寄生虫学实验室以及随后1986年建立的温州医科大学检验系教学实验室。上述实验室注重软硬件建设，在各个时期，为温州医科大学各方面的人才培养，尤其是人才培养方式中实践技能的培养提供了有力的保障。
健康与环境生态研究所筹建于2006年6月。我所紧密结合有害生物防治的实际需要，以国家社会、经济和学科发展为导向，以创新性为己任，立足浙江，面向全国，针对危害人类健康的环境、有害生物进行基础和应用研究，开发基于化学信息素技术的环境生态型的创新技术和产品，并推广至生产第一线。
湖州市第三人民医院创建于1951年11月，是浙江省三级甲等专科医院，原浙江省精神病院。医院以心理、精神障碍诊治（包括普通精神科、心身科、老年精神科、临床心理科、司法鉴定、儿少心理科、睡眠医学、心理应急救援等）为主，内科、老年病科、神经内科和风湿免疫科、外科、妇科、疼痛科等特色专科为辅，是一家以“大专科，兼综合”相互保障、共同发展为业务特色的医院。
平阳县人民医院创建于1939年，是一所集医疗、教学、科研、预防和保健为一体的三级乙等综合性医院。系温州医科大学附属平阳医院、浙江省高等医学院校教学医院、温州医科大学教学医院、省级绿色医院、省级平安医院、省级爱婴医院、省级健康促进医院，浙江大学医学院附属第一、二医院协作医院、中国人民解放军海军总医院合作医院、台湾奇美医院合作医院、浙江省眼视光专科联盟成员单位及温州医科大学附属眼视光医院医疗联合体成员单位、浙江大学医学院附属儿童医院儿科联盟单位，承担着鳌江流域200多万人口的医疗保健任务。
湖州市中心医院始建于1944年，前身为浙江省立传染病医院、浙江省立第二医院。建院77年来，始终秉承“医求卓越、德致高远”的理念,承担着湖州及安徽宣城、江苏吴江等周边地区400多万人的医疗健康服务工作，是浙北地区规模最大的集医疗、科研、教学、预防、保健、康复于一体的综合性医院。
台州市第一人民医院，始建于1940年，是一所集医、教、研、康复为一体的三级乙等综合性医院，台州市首批互联网医院。医院坐落于台州市黄岩城关横街路218号，占地面积3.35万平方米，建筑面积约10.5万多平方米，核定床位1200张。总建筑面积18万平方米，投资12余亿元的新院区工程于2015年1月14日开工奠基。
温州市人民医院于1913年9月建成开诊，前身系天主教仁爱会创办的教会医院，是浙江省最早的西医医院之一。建院一百多年，已成长为一家集医疗、教学、科研、康复、预防保健于一体，历史文化底蕴深厚、医疗科研实力雄厚的三级甲等综合性医院。既有突出的综合实力、又有鲜明的专科特色，在浙南闽北地区享有较高的知名度与美誉度。
瑞安市人民医院（温州医科大学附属第三医院）建成于1937年，是瑞安地区规模最大的集医疗、科研、教学、预防、保健、康复于一体的大型综合性三级甲等医院。
台州眼视光医院（温州医科大学附属眼视光医院台州院区），是在台州市中心医院原有眼科的基础上，依托温州医科大学附属眼视光医院先进的医疗技术团队和高端的仪器设备，有专业的激光近视手术技术。是一家是一家集医疗、教学、科研、产业、公益、推广为一体的国际化眼科专科医院，致力于建设成为浙江省内知名眼科医院。
温州医科大学附属眼视光医院成立于1998年，2009年经省卫生厅批准增挂“浙江省眼科医院”,是目前浙江省唯一三级甲等眼科专科医院，在2020年中国医院科技量值（STEM）综合排行榜中，位居眼科专科医院第一，在眼科学专科排行榜中，医院科技产出连续3年全国第一。
温州医科大学附属眼视光医院成立于1998年，2009年经省卫生厅批准增挂“浙江省眼科医院”，是目前浙江省唯一一家三级甲等眼科专科医院。医院承担临床医疗、医学教育、医学科研、预防保健等任务，是国家临床医学研究中心（眼耳鼻喉疾病）、眼视光学和视觉科学国家重点实验室、国家眼视光工程技术研究中心、国家药监局眼科疾病医疗器械和药物临床研究与评价重点实验室以及国家眼科学临床重点专科、教育部近视防控与诊治工程研究中心。经过二十余年的发展，医院形成了集医疗、教学、科研、产业、公益、推广为一体的眼视光体系。
