人事处是在学校党委和行政领导下,负责学校人事管理工作的职能部门。

科技处前身为科研科,成立于1979年,隶属教务处,1991年脱离教务处为学校直属科,1993年10月正式命名为科技处。

吉首大学发展规划与学科建设处/省部共建工作办公室 地址：湖南省湘西土家族苗族自治州吉首市人民南路120号

离退休工作处是学校党委、行政领导下的负责离退休人员日常服务与管理工作的职能部门,设有办公室、综合服务科、活动指导办三个科室。离退休工作处设党总支,下辖1个行政党支部和7个离退休党支部。现有离退休人员近600人,党员280余人。

党委学生工作部、学生工作处、党委武装部工作职责,执行上级党组织和学校党委的指示、决议,拟订和实施学校学生工作和人民武装的各项意见和措施。

吉首大学党委统战部先后与宣传部、组织部合署办公,2016年底从组织部分离单设。作为学校党委的职能部门之一,主要负责学校党外知识分子工作、民主党派工作、对台、侨务工作、民族宗教工作、统战理论政策研究与宣传教育工作及在党委领导下做好党外人士的培养工作和政治实职安排,特别是党外代表人士的培养、推荐和考察等工作。现任部长为党委委员鲁荣波教授。下设党外知识分子工作科和综合科两个科室。

吉首大学党委宣传部主要负责学校宣传思想、政治理论学习、意识形态、对内对外宣传、精神文明及校园文化建设工作,校级媒体（包括新闻网、校报、广播电视台阵地）的建设与管理；统筹学校思想政治教育、法制宣传教育、文化传承、舆情信息监控及管理工作；履行宣传思想工作中的保密职责；做好本单位党建工作及学校党委、行政交办的其他宣传工作。

中共吉首大学委员会办公室、吉首大学校长办公室是学校党委和行政的综合办事机构,实行两块牌子、一套班子的工作体制。

吉首大学关心下一代工作委员会 地址：湖南省湘西土家族苗族自治州吉首市人民南路120号

吉首大学工会（全称中国教育工会吉首大学委员会）是学校党委领导下的全校教职工自愿结合的工人阶级群众组织。成立于1958年,伴随着学校五十年前进的步伐,不断进步和发展。现有分工会27个,会员１６00余人,下设经费审查委员会和女职工委员会。

教学质量监控与评估中心/教师（教学）发展中心/教育科学研究院独立设置于2016年,是在学校党委和行政领导下,负责学校教学质量管理、教师教学发展培训以及教育硕士点建设等工作的职能部门。本部门由教学质量监控与评估中心、教师（教学）发展中心、教育科学研究院三个单位组成,合署办公。

吉首大学教务处是主管吉首大学本科教学工作和实施教学管理的职能部门。地址:湖南省吉首市人民南路120号实验室与设备管理中心办公室

武陵山区发展研究院成立于2013年，其前身是2010年由湖南省科技厅批准建立的软科学重点研究基地“武陵山片区区域发展研究中心”。2014年，为进一步强化校地合作工作地顺利推进，学校成立了校地合作领导小组，武陵山区发展研究院承担校地合作领导小组办公室的日常工作。

2006年以来,学校相继修建了六个文化教育场馆：黄永玉教育博物馆、沈从文纪念馆、武陵山生物科学馆、校史馆、湘西民族文化博物馆、生态民族学博物馆,统称为“湘西文化博览园”。

湖南吉大资产经营管理有限公司,是根据教育部文件精神而专门组建的唯一代表吉首大学管理、营运所有经营性资产和所投资企业股权的一家国有全资企业。公司以经营和管理所持有的或受托管理的股权和经营性资产为己任,确保国有资产的保值和增值。