厦门大学是教育部直属重点综合性大学，是国家“985”、“211”工程重点建设的高校。厦门大学药学院成立于2010年，是在原厦门大学生物医学研究院、医学院药学系的基础上，集聚生物医药研究的精干队伍而成立的，一个荟聚海内外精英，培养社会应用人才，致力于自主知识产权原创性新药研发的综合型、创新型学院。

厦门大学公共卫生学院正式成立于2011年5月20日，是以国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心和医学院原预防医学系为基础组建的。

厦门大学是中国高等教育发展史上最早创办航空教育的高校之一。20世纪40年代,厦门大学就创办了机电工程系、航空工程系，组建了当时厦大师资水准最高、对学生最具吸引力的工科学科；始建于1972年计算技术与自动控制专业的自动化系，上世纪80年代即与我国航天科技领域密切合作。

能源学院是在能源研究院的基础上发展起来的。能源研究院成立于2007年9月，它以国家能源科技重大需求和海峡西岸经济发展为导向，通过整合、引进、提高，建成我国一流的集人才培养、技术研发和技术转移于一体的新能源基地。2013年初，能源研究院新设本科专业“新能源科学与工程”获得教育部备案批准，2013年5月，厦门大学决定成立能源学院。能源研究院保留名称，作为能源学院的所属研究机构。2013年9月，第一届“新能源科学与工程”新生入学。

厦门大学的工科办学历史可以追溯到1922年7月学校增设的工学部，1923年4月，工学部改为工科，1924年6月，工科归并到理科，下设工程学系，土木工程教授田渊添任物理学系主任兼工程学系主任。1926年8月，工程学系独立为工科，下设土木工程系、电气工程系、机械工程系。

厦门大学材料学院成立于2007年，是我国高水平材料类专业人才培养和高水平材料科学研究的重要基地之一。学院下设材料科学与工程系和生物材料系。材料科学与工程系源于1960年设立的高分子专门化方向，1986年首创设立了材料化学专业，并于1997年建系；生物材料系的前身为2002年成立的厦门大学生物医学工程研究中心。

为适应我国经济结构战略性调整的要求和软件产业发展对人才的迫切需要，实现我国软件人才培养的跨越式发展，教育部和国家发展和改革委员会（原国家发展计划委员会）共同研究决定选择部分高等学校，采取多项扶持政策，支持其试办示范性软件学院。

厦门大学物理科学与技术学院设有物理学系和天文学系。厦门大学物理学科始建于1923年，在中国物理学发展史上扮演了重要角色，是最早创立国家半导体学科的五校联盟之一，培养了谢希德、曾融生院士等杰出校友。

厦门大学数学学科办学历史悠久，1923年成立算学系，是厦门大学最早设立的系之一。2003年成立数学科学学院。经过近百年的建设与发展，数学学科已进入ESI全球前0.5%，为“双一流”建设奠定了厚实的学科基础。

厦门大学创意与创新学院是厦门大学与英国创意艺术大学在设计学领域开展合作，以厦门大学设计学科为基础，2019年经教育部批准设立非独立法人的中外合作办学机构。学院的设立，是厦门大学和英国创意艺术大学为国家中长期发展培养创新型人才，加快“双一流”建设步伐，提升服务地方经济建设发展能力的重要举措。

2005年，为了顺应国际化办学趋势，厦门大学成立了国际学院。国际学院作为厦门大学29个直属学院之一，专门从事国际留学教育，积极引进国外优质的教育资源，结合厦门大学完善的教学软硬件条件，涵盖了从预科到本科的教学体系，全力培养各类高素质的国际化人才。

厦门大学社会学和人类学专业办学历史悠久。1921年建校之初就设立了社会学本科专业，并成立了历史社会学系，是国内最早的社会学系之一，顾颉刚、容肇祖、史禄国等学者都曾在我校任教。1931年，著名人类学家、社会学家林惠祥任历史社会学系主任，自此社会学和人类学得到长足发展。1951年，当时的中央高等教育部批准厦门大学建立了中国高校第一个、也是至今唯一的人类博物馆。

厦门大学体育教学部设立于1921年学校创建之初，其前身为体育教研室。在陈嘉庚先生的大力倡导下，厦门大学体育健身运动蔚然成风，形成了良好的校园体育风气和重视体育的优良传统。体育教学部由球类Ⅰ教研室、球类Ⅱ教研室、武术教研室、体操教研室、户外运动教研室和办公室组成。

厦门国际法学院（厦门学院）位于中国美丽的城市厦门，于2005年7月在海牙和平宫举行了第一次馆长会议后成立。向对国际法的发展和使用特别敏感的个人提供最高水平的教育，例如国际法年轻的讲师，外交官，法律从业人员，负责外交事务的政府官员以及国际组织的官员。该学院的使命是促进全球法律界之间的学术交流，鼓励对重大国际问题的研究，并以此寻求途径来改善世界和平与国际合作的可能性。

厦门大学知识产权研究院是根据2008年5月国家知识产权局与福建省人民政府签订的《共同推进海峡西岸经济区知识产权发展合作议定书》和省部会商要点的精神，由厦门大学与福建省知识产权局共建成立的集科研、教学、国际交流与社会服务于一身的多功能、高层次的知识产权研究平台和人才培养基地。