烟台大学外国语学院成立于1999年，由外语系和语言培训中心合并组建而成。外语系是烟台大学建校之初成立最早的院系之一，1985年开始招收本科生，1989年获学士学位授予权。外国语学院2001年获硕士学位授予权，2010年获批外国语言文学一级学科硕士学位授予权和翻译硕士专业学位授予权。

国际教育交流学院是烟台大学开展国际教育的特色学院，其前身是1988年成立的烟台大学国际文化交流部和1994年经山东省人民政府批准成立的烟台大学国际经贸学院。2003年，学校为了加强国际教育与对外交流，整合校内留学生教育、对外汉语本科教育、中外合作办学等资源，成立国际教育交流学院。

烟台大学音乐舞蹈学院成立于2004年，现有音乐学、舞蹈编导两个本科专业学院现有教职工51人，其中教授2人，副教授8人，博士3人，另有3人博士在读，90%以上的教师获得了硕士以上学位,具有海外留学经历的教师占全院教师总数的50%以上。学院现设有音乐理论教研室、声乐教研室、舞蹈教研室、西洋管弦教研室、键盘教研室、民乐教研室、艺术实践部。

烟台大学数学与信息科学学院始建于1984年，其前身是由北京大学和清华大学依据原国家教委的指示对口援建的烟台大学数学系。1989年，烟台大学数学系更名为烟台大学数学与信息科学系。2006年8月组建成立烟台大学数学与信息科学学院。

烟台大学物理与电子信息学院的前身是1984年由北京大学选派教师支援创建的烟台大学物理系，2000年成立光电信息科学技术学院，2021年更名为物理与电子信息学院。目前设置3个系（物理系、电子系和通信与物联网系）、2个实验中心。近年在专业建设、人才培养、队伍建设、教学科研等方面均取得快速发展。

烟台大学化学化工学院前身为1984年由北京大学生物系和清华大学化工系分别援建的生物化学系和化学工程系。1990年，两系合并为化生系。1992年，化生系分为化学工程系、生物化学系和应用化学系。1995年，化学工程系、应用化学系、生物化学系、食品科学与工程研究所、分析测试中心等共同组建烟台大学第一个二级学院—化学生物理工学院。2011年4月，化学生物理工学院更名为化学化工学院。

烟台大学生命科学学院前身为1985年由北京大学援建的生物化学系的生物化学、微生物学专业和清华大学援建的化工系的生物化工、食品科学工程专业组成，后经多次优化调整，相关学科在人才培养、科技创新及服务社会等方面取得突出成就，办学规模不断扩大。2011年春，经学校再次调整，将生物科学、生物技术、生物工程及食品科学与工程、食品质量与安全5个本科专业合并，新组建成生命科学学院，2018年经再次专业调整，暂停生物技术专业，新上生物制药专业。同时，2013年烟台大学与烟台市农业科学研究院合作成立农学院（以联合培养农业硕士

2000年8月，烟台大学和山东绿叶制药有限公司（简称：绿叶制药）各投资50%成立了烟台大学药学院。药学院的办学宗旨是通过新的办学模式充分利用大学和企业双方的教育资源、人才优势和研发条件，实现“产、学、研”实质性联合，探索出一条新的人才培养途径。

1985年3月，清华大学计算机系援建烟台大学电子学与计算机科学系，历经30余年的发展，学院现有计算机科学与技术、软件工程、自动化、智能科学与技术四个本科专业，有“计算机科学与技术”一级学科硕士点和“计算机技术”专业硕士点，有研究生、本科生2300余人。学院现有教职工91人，其中，专任教师76人，教授 13人，副教授 36人，博士后、博士 47人，在读博士4人，拥有山东省泰山产业领军人才1人，省级教学名师2人，烟台市双百计划1人，校级教学名师1人，有纽约州立大学宾汉姆分校、佐治亚州立大学、加拿大等兼职教授3

烟台大学机电汽车工程学院其前身烟台大学机械系，始建于1984年，是烟台大学建制最早的系部之一，由清华大学“精密仪器与机械学系”对口援建。学院目前设有机械设计制造及其自动化、车辆工程和机器人工程3个本科专业，以及1个机械工程一级学科硕士学位授予点和1个机械专业学位类别硕士学位授予点，工程学进入全球ESI前1%。

烟台大学土木工程学院的前身为烟台大学建筑工程系，创建于1984年。建筑工程系的创建与发展得到了清华大学土木工程系的大力支持。清华大学土木工程系张铜生教授、郑金床教授先后任土木工程系的前两届主任。陈肇元院士、过镇海教授、沈聚敏教授等著名专家都直接参与了建筑工程系的组建、规划与重点建设。经过这些著名专家的精心策划和悉心指导，通过全体师生30多年的辛勤努力，土木工程学院不断发展壮大，教学与科研水平不断提高，已成为山东省土木工程专业人才培养的重要基地。

烟台大学海洋学院成立于2001年，其前身是建于1951年的山东省水产学校。经过近70年的发展积淀，已经形成了较为完整的专业体系，学院现有水产养殖学、海洋科学、轮机工程、航海技术和能源与动力工程5个本科专业。其中，海洋科学、水产养殖学和能源与动力工程专业入选“山东省教育服务新旧动能转换专业对接产业专业群”；能源与动力工程专业获批国家级“卓越工程师教育培养计划项目”、山东省一流专业、山东省“名校建设工程”项目。海水生态养殖实验室为烟台大学科研创新平台和学科特区，水产养殖学专业入列烟台大学创新教育实验区。山东省

烟台大学环境与材料工程学院成立于2001年4月，经过二十年的建设与发展，现已成为烟台大学的重点院系之一。学院获得山东省一流学科1个、一级学科硕士学位授权点2个、专业硕士学位授权点1个，拥有山东省材料工程示范实验中心、山东省空气净化工程技术研究中心等省部级科研平台。学院设有环境科学与工程、材料科学与工程两个系，现有教职工93名，其中教授19名，副教授28名，高级实验师3名。教师中具有博士学位者62名，占专任教师的86％。学院在校学生2000名，其中硕士研究生200余名。

1984年，烟台大学建校，设立建筑工程系，由原清华大学建筑系创建。清华大学建筑系著名教授朱畅中先生担任建筑工程系第一任系主任，清华大学建筑系陈浩凯先生担任副系主任分管建筑学专业。建校初期，清华大学建筑学院的教授亲自来校授课，为烟台大学建筑学院奠定良好的基础和较高的起点。

核装备与核工程学院成立于2018年7月18日。学院以国家和地方社会经济需求为导向，以打造胶东半岛及国家核电产业急需的核装备与核工程技术人才培养高地、新旧动能转换重大工程示范基地和创新基地为目标，以烟台核电装备产业集群和国家级核电研发中心为支撑，致力于实现产学研用、校所城产深度融合发展。