嘉兴学院平湖师范学院（应用技术学院）是嘉兴学院二级办学单位，其前身浙江省平湖师范学校办学肇始于1917年，至今已有100多年历史，学院积淀了深厚的文化底蕴和丰富的办学经验，在省内外享有较高知名度和美誉度，是红船旁基础教育教师培养的“摇篮”。
马克思主义学院是学校二级教学科研管理机构，是浙江省重点建设马克思主义学院，下设教研室5个，拥有教育部人文社科重点研究基地“中国共产党革命精神与文化资源研究中心”、教育部全国高校思政课骨干教师社会实践研修基地、浙江省人文社科重点研究基地“嘉兴学院浙江省中国共产党创建史研究中心”、浙江省中国特色社会主义理论体系研究中心嘉兴学院基地等多个省部级平台。
体育与军训教部（简称“体军部”，下同）是学校实施体育教学与学生军训工作职能的重要部门，负责全校公共体育课程教学、运动队训练、群体竞赛和国防教育、军事训练等工作。
嘉兴学院成人教育学院、继续教育学院、党员教育基地（原南湖干部学院）合署办公是代表学校负责成人高等教育、高等自学考试及非学历教育培训的办学实体和管理机构，三院合署办公，对全校成人教育、继续教育实施全面管理。下设学院办公室、学历教育中心、继续教育中心、技能培训中心等4个科级机构。
作为党的诞生地的大学，学校把大力弘扬“红船精神”与贯彻落实“创新创业”战略紧密结合，秉承“方正为人勤慎治学”校训，致力于培养具有创新精神、实践能力和社会责任感的高素质应用型、复合型人才。
嘉兴学院是2000年3月经国家教育部批准的普通本科高校，实行“省市共建共管，以省为主”的管理体制。学校办学所在地——嘉兴，地处东南沿海、长三角中心腹地，东接上海、北邻苏州、西连杭州、南濒杭州湾，区位优势独特，产业发达、经济繁荣，是江南文化发源地、世界互联网大会永久会址地、浙江省全面接轨上海示范区。
嘉兴市第一医院（嘉兴学院附属医院）位于中国革命红船的启航地——嘉兴南湖之畔。医院始建于1920年，经过几代人的艰苦创业，已成为嘉兴市规模最大、设施齐全、技术力量雄厚的集医疗、科研、教学、预防、康复于一体的三级甲等综合医院。医院的业务范围：承担医疗与护理保健服务及开展医学研究、教学等工作。
主办： 嘉兴市妇幼保健院（嘉兴市妇幼保健计划生育服务中心、嘉兴市市立三一医院） 、嘉兴学院附属妇儿医院、温州医科大学附属嘉兴市妇女儿童医院；地址：浙江省嘉兴市南湖区中环东路2468号
嘉兴市第二医院始建于1895年，目前为嘉兴市中心布局合理、功能齐全、技术先进、服务优良、融医疗、教学、科研、康复及预防保健于一体的浙江省三级甲等综合性医院。是国家级高级卒中中心，国家首批全科医生规范化培训示范基地，国家住院医师规范化培训基地，国家级康复护理专科护士培训基地，中国医师人文医学执业技能培训基地，是浙江省第三家、嘉兴市第一家通过全国胸痛中心论证单位、全国综合医院中医药工作示范单位,地级市唯一一个浙江省肢体功能障碍康复临床医学研究中心。
嘉兴学院附属江南医院挂牌仪式在武警浙江省总队医院举行，武警浙江省总队医院正式成为嘉兴学院附属医院。
浙江新安国际医院位于秀洲区核心区域，秀湖之畔，是秀洲区人民政府、嘉兴市卫生局于2003年11月共同引进的中外合资医疗项目。医院已于2009年4月21日正式开业，作为浙江省医保定点医院、嘉兴市五县两区城乡合作医疗保险定点医院、120急救网络定点医院，是嘉兴市医疗卫生体系的重要组成部分。2017年4月21日，成为嘉兴学院附属新安国际医院。
浙江省荣军医院（嘉兴市第三医院）是浙江省退役军人事务厅直属的省级优抚医院，承载着收治全省一至四级伤残军人，并为其提供医疗、康复服务；为全省重点优抚对象提供短期疗养和巡诊巡检服务；为全省优抚对象提供慢性病医疗、康复服务；为全省伤残军人提供等级鉴定服务；开展优抚医院医学研究、医学教学和医学交流；坚持平战结合，为驻地群众提供公益性医疗服务；协助开展全省优抚医疗保障和医养结合事业调研评估等重要任务。
主办：嘉兴学院科学技术研究院 ；地址： 浙江省嘉兴市南湖区广穹路899号
嘉兴学院人文社会科学研究院（IHSS）是集人文社会科学研究、人才培养和学术交流于一体,嘉兴学院独立设置的实体性科学研究机构。IHSS的宗旨是：辨章学术，培养新知。IHSS的目标定位是：践行嘉兴学院“有特色、善创新”的办学理念，以建设有影响的人文社会科学学术高地为目标，重点聚焦伟大建党精神与中共创建、中外政党与政治、区域经济与共同富裕、红色文化与浙江发展、浙西学术与江南文化等特色领域，形成文科高层次研究集群，提升嘉兴学院人文社会科学的总体实力。
中澳先进材料与制造研究院（IAMM）是嘉兴学院直属科研机构，由嘉兴学院与澳大利亚南昆士兰大学于2016年12月联合成立，由浙江省级特优人才、南昆士兰大学王浩教授担任研究院名誉院长，浙江省“钱江高级人才”特聘教授曹雪波担任执行院长，徐之光教授和李在房教授担任副院长。研究院本着充分挖掘中澳科研合作潜力，进一步提升嘉兴学院科研水平的目的，以国家和地方需求为导向，结合学校现有学科特色，充分利用中澳双方先进的材料研究技术和中国巨大的材料生产和应用能力，发展可持续、环境友好型绿色材料。
