基础教学部以学校的办学指导思想、学校的办学定位和人才培养目标为指南，坚持教学工作的中心地位，以课程建设为主线，建立健全教学质量保障和监控体系，积极深化教学改革，努力提升教育教学质量。
思想政治理论教育教学部（简称思政部）成立于2016年3月。2019年11月思政部正式成为独立设置直属学校领导的二级机构，现有马克思主义基本原理、毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论、习近平新时代中国特色社会主义思想概论、中国近现代史纲要、思想道德与法治、形势与政策六个教研室，承担着全校思想政治理论课教学与科研工作。思政部设主任一名，副主任一名，教学科长一名。
动力与电气工程学院是山西应用科技学院一个具有深厚工科底蕴、鲜明应用特色的二级学院。经教育部批准，2016年设置汽车服务工程专业，2018年设置交通工程专业，2019年设置新能源科学与工程专业、电气工程与智能控制专业，2021年设置轨道交通信号控制专业。
山西应用科技学院作为山西省深化创新创业教育改革示范高校之一，深入贯彻《关于大力推进高等学校创新创业教育和大学生自主创业工作的意见》（教办〔2010〕3号）等相关文件精神，秉承“求知 修德 强能 报国”的校训，不断深化创新创业教育改革，2014年率先提出“创新意识 创造能力 创业目标”为核心的教育理念，首创“1+1”实验班，开启个性化“三创”人才培养之路。
信息工程学院是山西应用科技学院的二级学院。学院设有计算机科学与技术、软件工程、电子信息工程、机器人工程、大数据管理与应用、电信工程及管理6个本科专业和计算机科学与技术、软件工程、电子信息工程3个专升本专业，本学院在校本科学生2000余人。
建工学院成立于2014年6月（前身为建工系），学院现有土木工程、工程造价、工程管理、风景园林、工程审计五个本科专业，2022年工程管理专业被评审为山西省一流专业建设点，土木工程专业被评为校级一流专业。学院的“管理科学与工程”学科是山西省“1331工程”优势特色学科。
财经学院是山西应用科技学院的二级学院，在原有的会计系和经济系的基础上，成立于2014年。学院设有党总支、办公室、教学科、学生管理科、分团委等机构。学院有独立的实验实训室、资料室。
管理学院随着山西应用科技学院2014年升本，合并原工商管理系、旅游管理系成立管理学院。学院发展历史虽几经变迁，但商科教育的主脉始终未断。 所设专业涉及管理学与教育学两大学科，涵盖物流管理、市场营销、酒店管理、健康服务与管理、学前教育五个专业，目前在校生达到2000余名。
音乐学院前身是山西兴华职业学院音乐系，2014年学校升本后扩建为艺术学院，2017年从艺术学院独立设置为音乐学院。学院秉承“以质量求生存，以特色求发展”的办学宗旨，遵循“职业性与学术性融合，课程设置与市场需求接轨”的核心理念，践行“产教融合、校企合作、学以致用”的办学思路，培养德、智、体、美、劳全面发展，集编创、策划、合唱、合奏、指挥、表演于一身的复合型、应用型人才。在人才培养过程中形成独特的办学特色。
美术学院是山西应用科技学院下属的二级学院，美术学院前身美术系成立于1991年，目前有视觉传达设计、数字媒体艺术、书法学三个本科专业，其中视觉传达设计专业2021年被评为校级一流专业。学院面向省内外统一招生，现在校生1930人。
文化传媒学院由原编播教研室不断改革拓展，面向地方广电传播、区域融媒发展和文旅产业管理的实际需求，正式成立于2020年5月。主要开设播音主持艺术、广播电视编导、文化产业管理三个专业。学院管理规范、作风严谨，教师甘于奉献、充满活力，结构日趋合理。始终以立德树人为根本任务，将价值塑造、知识传播和能力提升全面融合；努力培养集采摄编、评写说、播创管于一体，自觉服务中国特色社会主义建设的高素质应用型人才。
江西应用科技学院始建于1984年，是经国家教育部批准设置的具有独立颁发国家高等教育学历资格的全日制普通本科高校。学校现有本、专科专业59个，内设14个教学单位：人工智能学院、软件与区块链学院、智能制造工程学院、建筑工程学院、国际商务学院、财经学院、现代管理学院、光华宝石与艺术设计学院、音乐学院、教育学院、体育学院（公共体育教学部）、马克思主义学院、公共教学部、创新创业学院。与英国基尔大学合作举办“大数据与会计学”“大数据与财务管理”专业。
计算机科学与应用系简称计算机系，始建于1999年，按照学院“理论够用，强化技能，注重德育，一专多能”的教学指导思想致力于教学。全系形成“求真、尚能、敬业、爱生”的文明教风，以“树立目标，坚定信念，惜时如金，奋力拼搏，塑造自己，挖掘智慧，设计明天”的理念勉励学生。
2020年6月12日 成立的北京雁栖湖应用数学研究院将应用数学纳入未来学科发展规划，着眼于基础学科研究的产业应用。
清华大学化工系应用化学研究所成立于1997年,现有教职工及博士后共6人，在读研究生(博士和硕士)16人。
