南京信息工程大学是国家“双一流”建设高校，是江苏高水平大学建设高校。学校始建于1960年，应新中国国家战略和国民经济建设需求而生，隶属中央（军委）气象局，前身为南京大学气象学院，1963年独立建校为南京气象学院，1978年列入全国重点大学，2004年更名为南京信息工程大学。2007年以来，先后实现了江苏省人民政府、中国气象局、教育部、国家海洋局的多方共建。
南京信息工程大学高等教育研究所成立于2006年，是学校从事高等教育研究的专门机构，也是为学校发展提供决策参考的咨询机构。部门主要承担学校发展和运行过程中的高等教育学有关的理论研究、政策研究、研究生培养等职能。高等教育研究所现有教职工5人，其中博士4人，硕士1人；教授1人，副教授2人；另有兼职研究人员数人。
南京信息工程大学期刊社成立于2009年，是南京信息工程大学正处级建制的直属单位，负责对南京信息工程大学主办期刊的统一管理工作。
全馆设置办公室、资源建设部、读者服务部、信息服务部、学科服务部、科技查新站6个部门。
南京信息工程大学档案馆的前身是南京气象学院综合档案室。1980年3月，学校为了加强文书档案管理工作，成立了档案室，隶属院长办公室。1982年11月，将原属教务处科研科管理的科技档案划归档案室管理。1986年1月，为适应学校教育事业的发展，在原有档案室基础上成立了综合档案室。2010年9月21日，校综合档案室升格为档案馆（副处级建制，挂靠校长办公室）。2010年11月16日，档案馆升格为正处级单位，独立运行，档案事业经费专款专用。2014年12月31日，档案馆获评省三星级档案馆,2015年12月25日，校档
南京信息工程大学创建于1960年，是一所以大气科学、信息科学与技术和环境科学工程为特色，理科、工科、商科综合发展的多科性的中国重点大学。学校拥有学士、硕士、博士和博士后培养的完整高等教育体系。
龙山书院成立于2018年6月，2019年6月正式实体运行。
南京信息工程大学马克思主义学院最早可追溯到学校1960年设立的马列主义教研室，经过社会科学部、社会科学系两个发展阶段，2005年更名为“思想政治理论课教育中心”。 2012年马克思主义学院成立，与公共管理学院合署办公。2014年10月，马克思主义学院独立运行。独立建院以来，马克思主义学院各项事业获得了快速发展。2017年，上海软科公布了对中国各高校的马克思主义理论学科排名情况，南京信息工程大学马克思主义理论排在第51名，位列前25%。
艺术学院（原名：传媒与艺术学院）成立于2008年5月，下设四系（动画、数字媒体艺术、设计艺术和美术系）一中心（实验教学示范中心）。开办动画、数字媒体艺术、艺术与科技、美术学（师范）、环境设计五个本科专业。其中，动画专业、艺术与科技专业为国家一流建设专业。与英国安格利亚鲁斯金大学合作举办“3＋1”数字媒体艺术专业，顺利通过教育部中外合作办学项目评估，获批江苏省首批中外合作办学高水平示范性建设工程培育点。拥有艺术硕士专业学位授权资格，涵盖艺术设计（环境设计、数字媒体艺术）、美术（中国画、油画、雕塑）、广播
南京信息工程大学继续教育办学历史悠久，1978年启动筹建成人高等教育，成立函授短训部；1981年更名为进修部；1990年更名为成人教育中心；1999年成立成人教育学院；2011年更名为继续教育学院。2020年，学校根据新时期继续教育高质量发展工作需要，成立继续教育处，与继续教育学院合署办公。
应用技术学院成立于2017年10月，是应国家“双一流”建设高校、江苏高水平大学建设高校⸻南京信息工程大学主动适应江苏省经济社会发展对高水平应用型人才的需求而设置。学院设有基础部、经济管理系、信息与控制系、计算机系、资源与环境系，面向先进制造业、现代服务业、战略性新兴产业和社会管理等重点领域设置了17个本科专业，目前在校生2000余人。学院坚持“开放发展、联合发展、产教融合、多元共建”的方针，高起点、高标准建成“ 结构合理、功能完备、运转高效”的高水平应用型人才培养体系，培养高素质创新人才和技术技能人才。
南京信息工程大学是国家“双一流”建设高校，江苏高水平大学建设高校。学校始建于1960年，应新中国国家战略和国民经济建设需求而生，隶属中央（军委）气象局，前身为南京大学气象学院，1963年独立建校为南京气象学院，1978年列入全国重点大学，2004年更名为南京信息工程大学。2007年以来，先后实现了江苏省人民政府、中国气象局、教育部、国家海洋局的多方共建，是以江苏省管理为主的中央与地方共建高校。
长望学院是南京信息工程大学专门培养拔尖创新人才的“荣誉学院”。学院以新中国气象事业的奠基人、首任中央气象局（现中国气象局）局长、我校建校的主要倡议者和缔造者涂长望先生名字命名，继承和弘扬“严谨求实，敢于创新；艰苦奋斗，勇于开拓；胸怀全局，团结合作”的“长望精神”。
南京信息工程大学人工智能学院组建于2019年6月，由电子与信息工程学院信息工程系整合优化并新增人工智能本科专业组合而成，是学校重点建设的特色学院之一。学院历史可追溯到1999年的计算机科学与技术系的信息工程专业。2021年7月学校成立人工智能学院（未来技术学院）。
南京信息工程大学大气科学学院前身是1960年南京气象学院创建时建立的气象学系，是国务院1978年首批硕士学位招生点挂靠院系，1988年，天气动力学被批准为国家气象局重点学科。1993年，天气动力学专业获得博士学位授予权，1997年，气候学被批准为中国气象局重点学科，1998年，大气科学一级学科获博士学位授予权，1999年获准设立大气科学一级学科博士后科研流动站。
