电子科学系的前身为始建于上世纪五十年代的无线电物理和半导体物理。该学科曾经创造过许多国内第一，在厦门大学发展史上写下了辉煌一笔。
厦门大学电子工程系1985年创系，在学校和学院的大力支持和全体教师辛勤工作下，历经35载，不断发展壮大、开枝散叶，2003年孕育出厦门大学通信工程系，2019年抽调大量师资组建厦门大学微电子与集成电路系。目前设有“电子信息工程”本科专业（国家级一流本科专业建设点），涵盖“电子科学与技术”一级学科博士点下“物理电子学”、“电磁场与微波”、“电路与系统”和“光电工程”4个二级学科。
厦门大学拥有优良的人类学专业传统和深厚的历史底蕴。厦门大学人类学与民族学系的学术渊源和机构基础可以追溯至著名的人类学家林惠祥先生于1934年创办的厦门市人类博物馆筹备处和1951年中央高教部批准成立的厦门大学人类博物馆以及50年代厦门大学历史系的考古、民族学专门化等。
厦门大学哲学系于 1922年创办之初，即吸引了海内外许多著名学者前来任教，他们在这里播种、耕耘，为该系的学科建设奠定了比较稳固的基础。目前，该系现已获得哲学一级学科博士授予权，哲学一级学科博士后流动站，涵盖马克思主义哲学、中国哲学、外国哲学、科学技术哲学、逻辑学、宗教学、伦理学、美学八个博士点。积数代人几十年如一日的辛勤劳作，该系取得了令人瞩目的学术成就，逐步形成了自己的研究特色。
厦门大学1921年创校以来，历史学一直是文科的传统优势学科。1924年6月，成立历史社会学系。1926年，设立历史系。历史系学科建设和人才培养成绩显著。中国经济史、中国古代史于1981年获首批博士学位授予权。专门史于1988年入选国家重点学科，在国内外具有较高学术影响力。
本系的发展历程可以追溯至1982年成立的厦门大学计算机科学系，2004年更名为信息科学与技术学院。拥有计算机科学与技术、信息与通信工程2个一级学科博士学位授权点和博士后科研流动站，智能科学与技术1个二级学科博士学位授权点。目前，计算机科学与技术、信息与通信工程为福建省重点学科，计算机科学与技术学科已进入ESI全球排名前1%。
厦门大学外文学院成立于1999年，前身外文系建于1923年，是厦门大学最早成立的院系之一。知名学者周辨明、林语堂、洪深等学贯中西的知名教授先后来系任教，著名诗人余光中、泰国侨领蔡悦诗、陈汉洲及金融业界精英朱德贞、李小加曾在此求学。
厦门大学国际中文教育学院/海外教育学院创建于1956年，历经华侨函授部、海外函授部、海外函授学院、海外教育学院、海外教育学院与国际学院合署等不同时期。2020年10月，为积极把握国际中文教育的新机遇，学校将海外教育学院与汉语国际推广南方基地/孔子学院办公室合并，学院更名为国际中文教育学院/海外教育学院。经过60年余的发展，学院已经形成了汉语国际教育与文化传播并重、学历教育与非学历教育兼备、面授教学与远程教育并举、理论研究与应用开发并行的特色，同时承担我校14所共建孔子学院管理与发展工作。
厦门大学经济学院是厦门大学规模最大的学院。现有经济学系、计划统计系、财政系、金融系、国际经济与贸易系和经济研究所、宏观经济研究中心、中国能源经济研究中心等8个教学科研单位，并设有教学实验中心。
厦门大学的政治学和行政学具有悠久的历史。1924-1926年，厦门大学建校之初就设立了政治学系科，历经四分之一世纪，于1952年全国院校调整时停办。1986年9月政治学系复办；2003年11月，由原法学院的政治学与行政学系、人文学院的社会学系和经济学院的人口研究所组建公共事务学院，并于2004年4月6日校庆日正式揭牌成立，2011年11月学校组建跨学科研究平台公共政策研究院。2019年3月社会学与社会工作系并入社会与人类学院。
厦门大学具有马克思主义研究的光辉历史和优良传统，是我国早期传播和研究马克思主义的重要阵地之一，曾经涌现出以王亚南为代表的一大批优秀马克思主义理论家和研究者。2011年8月，厦门大学在原马列主义理论教学部和马克思主义研究院的基础上成立了马克思主义学院。
厦门大学国际关系学院/南洋研究院的前身是南洋研究所。1956年由中国华侨事务委员会创办的南洋研究所，是我国最早设立的东南亚研究机构，也是我国最早的国际问题研究机构之一。1996年，南洋研究所升格为南洋研究院；2000年9月，在南洋研究院基础上成立的厦门大学东南亚研究中心被教育部正式批准为人文社会科学重点研究基地；2006年12月，成立国际关系学院/南洋研究院。
厦门大学继续教育学院是厦门大学组织实施在职继续教育的专门办学机构，是我校开展网络学历教育、高端培训和职业技术教育的教学单位。学院依托厦门大学雄厚的师资团队、教学力量和科研成果，围绕国家人才强国战略目标，坚持致力于国家经济建设和社会发展需要的人才培养。
厦门大学化学化工学院于1991年在化学系的基础上建立。张乾二院士、万惠霖院士、黄培强教授、江云宝教授曾先后担任学院院长。现任院长为谢兆雄教授。
生命科学学院现有生物学系、生物化学系、细胞生物学系、遗传与发育生物学系、免疫与微生物学系等五个系，拥有细胞应激生物学国家重点实验室、国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心、天然产物源靶向药物国家地方联合工程实验室、滨海湿地生态系统教育部重点实验室、国家级生命科学实验教学示范中心、寄生动物学研究室、分子诊断教育部工程研究中心等国家级教学与科研平台。学院的前身为生物学系，创建于1922年，迄今已培养造就了一批在国内外享有盛誉的著名专家学者。
