北京交通大学远程与继续教育学院是学校的二级学院之一，是一个办学实体。归口管理全校普通全日制以外的成人教育、网络教育、高等教育自学考试等各类本、专科高等学历教育，承担各种非学历教育培训和国际合作项目。学院设有办公室、招生办、教务部、教学服务中心、考务部、自考部、技术部、财务部、研发部、培训中心、留学服务中心、校本部学习中心等部门。

电子信息工程学院是北京交通大学最早成立的学院之一。学院下设3个系和10个研究所。分别为信息与通信工程系、自动控制工程系、电子科学技术系；光波技术研究所、下一代互联网国家工程实验室、现代通信研究所、宽带无线移动通信研究所、网络与安全研究所、电磁兼容研究所、运输自动化科学技术研究所、轨道交通控制研究所、先进控制系统研究所、国家电工电子教学基地。学院现有教职工275人，其中正高82人，副高115人，具有博士学位的教师占教师总数的93.58%，其中海外博士比例为13.1%。

北京交通大学是教育部是首批进入国家“211工程”建设高校，是全国具有研究生院的56所高校之一，计算机与信息技术学院为北京交通大学下属二级学院，学院成立于2000年3月，其前身是成立于1977年的我校电子工程系（后更名为计算机系）和创立于1978年的我校信息科学研究所等单位，是计算机与信息科学领域培养高端人才的摇篮和科研基地。

北京交通大学因铁路而生，由管理起家，其前身为1909年清政府创办的铁路管理传习所，是中国第一所专门培养管理人才的高等学府。

北京交通大学作为交通大学的三个源头之一，历史渊源追溯到1896年，前身是清政府创办的北京铁路管理传习所，是中国第一所专门培养管理人才的高等学校。“北京铁路管理传习所”创办的铁路管理班为交通运输学院创建之始。交通运输学院与母校同庚，是我国近代铁路管理教育的发祥地，经过百余年的积淀，形成了以铁路为优势和特色，涵盖公路、城轨、民航等多种交通方式的高水平教学和研究团队；建立了以交通运输领域为主，向物流、电子商务、安全科学与工程、控制科学与工程等领域拓展的高层次人才培养体系。

北京交通大学土木建筑工程学院成立于1996年，其前身是1956年成立的北京铁道学院铁道建筑系。经过60多年的时间，已从最初的单一铁道建筑本科专业系，发展至拥有多学科系所的综合性学院。

机械工程作为工科基础，历史可追溯至1909年，学校建校初期即设置了机械类课程。随着学校发展，1958年经教育部和铁道部批准，北京铁道学院成立铁道机械系，使得学校向工、管并举多科性大学的发展方向迈进了一大步。1997年成立机械与电气工程学院，2000年北京电力高等专科学校并入我校后，系所重新整合，成立机械与电子控制工程学院。

自1912年北京交通大学前身之交通传习所设置“高等电气工程甲班”至今，北京交通大学电气工程学科已有百年历程。建国后根据国家经济建设的需要，1958年北京铁道学院成立电气化工程系。2000年，原北京电力高等专科学校并入、学校归教育部直属管理后，电气工程相关学科专业重组成立北京交通大学电气工程学院。

北京交通大学数学与统计学院成立于2022年3月，前身始于1960年2月，北方交通大学应用理学系成立，设立了应用数学专业，1986年10月数学系成立，1996年7月合并成立文理学院，1998年成立理学院。近20年数学学科在学科发展、人才培养和科研上取得了突出成绩。

按照学校加强基础学科和新兴交叉学科建设的发展战略，北京交通大学物理科学与工程学院（简称物理工程学院）于2022年3月在原理学院物理系、光电子技术研究所、化学系和生命科学与生物工程研究院以及土木建筑工程学院力学系的基础上组建成立。作为学校应用基础学科和理工融合发展的主力军之一，物理工程学院成为学校培养基础拔尖人才和创新人才、建设特色鲜明世界一流大学的重要力量之一。

语言与传播学院成立于2009年，是北京交通大学直属二级学院。学院汇聚语言与传播两个学科，特色鲜明。设有英语语言文学系、传播学系、欧亚语言文学系、大学英语教学部、研究生英语教学部、翻译硕士（MTI）教育中心、语言实验教学中心等教学（教辅）机构，建有中国文化产业研究院、话语与跨文化传播研究中心、旅游文化创新与对外传播研究中心、语言研究中心、外国文学研究中心、翻译研究中心、传播学研究中心和文化产业研究中心等研究机构。

北京交通大学软件学院是经教育部、国家计委批准成立的37所国家示范性软件学院之一，成立于2003年3月。学院为国家示范性软件学院联盟理事长与秘书处单位，是国家级人才培养模式创新试验区，拥有国家级工程实践教学中心、国家级教学团队、国家级特色专业、国家级卓越工程师计划专业、北京市实验教学示范中心，荣获国家级教学成果一等奖、教育部国家示范性软件学院建设成就奖。

建筑与艺术学院的办学历史可以追溯到成立于1946年的原国立交通大学唐山工程学院建筑系（后为北方交通大学建筑系），1951年建筑系迁入北方交通大学北京校区办学。1952年底全国院系调整，建筑系迁往天津大学。1985年北方交通大学恢复建筑学专业招生，1991年建筑学专业本科学制改为五年。2002年增设艺术设计本科专业。2007年建筑系从土木建筑工程学院独立出来，成为学校直属的二级单位，命名为建筑与艺术系，2012年更名为建筑与艺术学院。

北京交通大学法学院2012年成立，是中国法学教育体系中一支年轻的力量，其前身为成立于1995年的北京交通大学法律系，为理工科院校中最早招收法学专业本科生的高校之一。北京交通大学法学院历史积淀深厚。“南洋公学”作为北京交通大学的前身，早在20世纪初就开办了政治特班，教授宪法、国际公法等专业法学课程，1921年成立的交通大学北京学校经济部铁路管理科课程体系中专门增加了国际法等法学专业课程，按欧美培养通才的方向，拓宽学生的知识面。在远东国际军事法庭代表中国指控日本战犯罪行的检察官向哲浚教授就曾在我校教授国际法学

按照学校加强新兴交叉学科建设的发展战略，北京交通大学环境学院在土木建筑工程学院的市政与环境工程系、交通能源与环境研究院的基础上组建成立。作为学校应用新兴交叉学科的主力军之一，环境学院将为我国生态文明建设、减污降碳协同增效、促进经济社会绿色发展、生态环境质量改善由量变到质变的转型培养拔尖和创新人才。