艺术学院前身是北京体育大学体育艺术系。2003年12月，经教育部、国家体育总局批准北京体育大学开设表演专业；2004年面向全国招收首批表演专业本科生；2005年2月学校成立体育艺术系；2013年开始招收舞蹈表演专业学生；2014年获批艺术硕士授予权；2017年5月正式更名为北京体育大学艺术学院。
自1957年北京体育大学招收留学生以来，先后培养了来自120个国家的28000余名长、短期留学生和进修生，目前每年接受来华留学生1000多人，其中攻读学位的在籍留学生300多名，2017年首次设立“北京体育大学一带一路体育人才”奖学金，招收来自42个国家和地区的百名国际学生；2017年12月，学校机构改革，国际文化学院变更为教学部门；2018年为适应新时期高校综合改革发展需要，优化学科专业布局，实现体育与文化的深度融合，搭建开放性、国际化、高水平、有特色的文、史、哲、艺交叉学科研究平台，为“通识教育、人文
北京体育大学继续教育学院（冬奥培训学院）是学校的二级学院，1953年建校伊始开展非学历继续教育，1981年开设学历继续教育，1988年函授部和进修部合并为函授进修部，1993年更名为成人教育部，2002年更名为成人教育学院，2010年变更为继续教育学院，2017年成立冬奥培训学院与继续教育学院合署办公。学院现开办学历继续教育和非学历继续教育。
教育学院（体育师范学院）是我校最早建立的院系，其前身可以追溯到1917年北京高等师范学校创建的体育专修科，这是中国近代最早建立的体育系科之一。1952年北京师范大学体育卫生系整体调入筹建中的中央体育学院（现北京体育大学），这批学生成为1953年我校建校后体育学科的第一批学生。教育学院（体育师范学院）从1955年成立之初的体育系，到1990年更名为体育教育系，再到2002年更名为教育学院，到2019年又再次更名为教育学院（体育师范学院）。
心理学院起源于北京体育学院“体育理论教研室”，于1958年设《运动心理学》本科课程，于2003年正式成立北京体育大学应用心理学专业（运动心理）本科。2008年，运动心理学成为北京市重点学科。2010年，获批心理学一级学科硕士学位授予权。2017年，学校为了进一步加强学科专业建设，提升办学层次和办学水平，适应体育、教育事业改革发展需要，回应国家重大战略需求，正式成立心理学院。
北京体育大学运动人体科学学院前身是成立于1958年的“体育理论系”，是学校最早成立的院系之一，2002年改为现名。现拥有运动解剖学、运动生理学、运动生物化学、运动生物力学、体质与健康五个专业方向。2002年，经教育部批准，运动人体科学成为国家级重点学科，是当时我国体育科学领域唯一的国家重点学科。
2004年北京体育大学获批成立运动康复与健康本科专业，2005年正式开始招生，成为国内首批招收运动康复与健康专业学生的高校。2008年4月，经国家体育总局批准成立运动康复系，2017年6月更名为运动医学与康复学院，2012年专业名称更改为运动康复。在研究生培养方面，在原有的运动人体科学（体育保健学）硕士点及运动人体科学博士点基础上，在2006年又增加了康复医学与理疗学硕士点，2010年成为临床医学一级学科硕士点，2016年增设运动康复硕士和博士点。2019年在临床医学下增设运动医学硕士点。现有本科生57
北京体育大学中国武术学院的前身武术系创建于1958年8月，2018年12月更名为中国武术学院（中华民族传统体育研究院），一个机构两个牌子。学院下设四个教研室：武术套路教研室、武术散打教研室、体育养生教研室（导引养生功中心）、民族民间体育教研室，四个研究中心和一个实验室：武术文化研究中心、武术训练竞赛研究中心、国际武术发展研究中心、传统运动康养研究中心和传统养生功法运动干预实验室，两个基地：国家体育总局龙狮培训基地及国家体育总局武术科学研究基地。
北京体育大学于2004年成立全国首个体能训练方向班，最早开始培养本科体能专业人才；2008年成立体能教研室，为人才培养奠定高水平师资基础；2017年率先通过教育部体能训练本科专业审批；2018年7月,为贯彻落实国家体育总局党组的要求，加强“两个奥运”服务保障工作，加快推动“双一流”建设，学校成立体能训练学院。同年10月，设立体能训练学院直属党支部。北京体育大学成为国内首个招收体能训练专业本科学生的高校。2020年学院获批国家级一流本科专业建设点，同年获批国家留学基金委创新型人才国际合作培养项目，为培养高质
体育休闲与旅游学院起源于教育学院“社会体育教研室”，于1995年设“社会指导与管理”专业，2012年设立“休闲体育”专业，并正式成立北京体育大学“社会体育系”。2018年设立“旅游管理”专业，并更名为“体育休闲与旅游学院”。
竞技体育学院始建于1957年，是北京体育大学最早成立的院系之一，是全国高校中首个培养出奥运冠军的学院。我校运动训练专业发展与新中国竞技体育事业发展紧密相关，溯源于1952年新中国首次参加奥运会，创建中央体育学院培养青训运动员。
中国足球运动学院是以培养高水平足球运动员、教练员和裁判员“三员”为重点的国家级足球专项学院。学院坚持“世界眼光、国际标准、中国特色、高点定位”的办学理念，致力于建立政府、高校与社会力量协同合作新体制，形成体育与科技、文化深度融合发展新机制，建立国家主导的足球青训体系，培养具有国家情怀、社会责任和国际水平的新时代足球运动人才。
中国篮球运动学院是北京体育大学下设二级学院，其前身为中央体育学院球类教研室篮球教学组，是我国体育院校最早成立的篮球运动专项教研室，为中国篮球事业发展做出了重要贡献。随着北京体育大学的改革发展，先后更名为北京体育学院体育系篮球教研室、北京体育大学教育学院篮球教研室，2017年独立建院，现隶属于北京体育大学奥林匹克学部。
中国排球运动学院对应北京体育大学建成世界一流体育大学的办学目标和“大学+基地”的办学定位，牢固树立人才培养的中心地位，以本科教育为基础、研究生教育为重点、青训工作为特色，为中国体育事业、高等教育事业和奥林匹克运动以及社会发展培养高端化、贯通化、国际化和协同化的高素质创新型体育人才。
中国田径运动学院隶属于北京体育大学奥林匹克运动学部，是实现与国家田径队及国家青年队全面深度对接的专业学院。按照高端化、贯通化、国际化、协同化原则，打造从小学、中学、大学和研究生的“一条龙”的教学、训练、科研和后勤服务保障的贯通化教育体系，实现具有中国特色的高水平田径运动员、教练员、裁判员和科研人员培养新模式。
