现代教育技术与信息管理中心成立于2009年9月，目前中心下设网络建设与管理科、综合科、信息系统科、电化教育科、旗山校区信息技术部。

根据学校事业发展的需要及“闽农林大党组〔2014〕7号”文成立科教基地管理中心。中心定位为教学辅助机构。在校党委和行政的领导下，以“在服务中求发展，在管理中求效益”为宗旨，围绕学校的各项中心工作，做好为教学、科研服务工作。

福建农林大学考试中心 地址： 福建省福州市仓山区上下店路15号

福建农林大学学生创新创业中心 地址： 福建省福州市仓山区上下店路15号

海洋生物产业已经成为国际上快速发展的战略性新兴产业之一，发展海洋生物产业已上升为国家战略。十九大报告提出“加快建设海洋强国”，具有重要的现实和战略意义。

国家菌草工程技术研究中心是依托福建农林大学建立的中国唯一的国家级菌草技术科研平台（下称“国家菌草中心”），现有固定人员110人，客座人员36人，拥有仪器设备184台套，拥有较强的菌草工程技术力量及较完备的产品研究开发条件，与国内外科研院所、企业建立了广泛的合作关系。

1956~1965年：成立福建省甘蔗研究所，著名甘蔗专家周可涌教授任所长,主持国家“二五”甘蔗栽培攻关项目，开始招收甘蔗方向研究生，出版中国第一部《甘蔗栽培学》,育成福农57-18等甘蔗新品种。

福建农林大学环境生物电化学研究中心成立于2014年11月。中心针对热带/亚热带水土资源特点，应用环境电化学、电微生物学、分子生态学等多学科交叉手段，解析电荷（包括电子、离子及其它电活性粒子）在水/土生态系统中的分布、转移、传输及其生态环境效应。

福建农林大学海洋研究院 地址： 福建省福州市仓山区上下店路15号

福建农林大学就业指导与服务中心 地址： 福建省福州市仓山区上下店路15号 校大学生活动中心西南侧2楼 学生创新创业中心 、学生档案室 明德楼104

福建农林大学公共体育教学部成立于2012年，副处级建制，设有办公室、球类教学组、综合教学组、武术健美操组、学生体质健康测试中心、体育场馆中心等机构。体育部师资结构合理。现有教职工39人，其中专任教师36人，行政管理及教辅人员3人。专任老师中，副教授（含享受待遇）18人，讲师16人，助教2人。在学校党政领导下，负责全校本科学生的体育教学、群体活动、运动队训练竞赛以及《国家学生体质健康标准》测试等工作。

福建农林大学马克思主义学院（以下简称“学院”）独立设置于 2009 年，是福建省高校中第一家独立设置的马克思主义学院。目前，学院拥有首批共青团中央研究基地“中国特色社会主义理论体系研究中心”（首批全国仅 3 个）、省首批社科研究基地“马克思主义中国化研究中心”以 及“省中特理论中心”等12个基地平台，并于2018年获批省重点马克思主义学院建设。

福建农林大学国际学院，是我校培养外语专业人才与执行中外合作办学项目的教育教学管理机构，同时负责来华留学生的招生与管理工作，与经济学院共享共建“教育部国别和区域研究中心——南太平洋岛国研究中心”，现有英语专业和4个中外合作办学本科教育项目。学院加强党的建设和思想政治教育，坚持立德树人，自觉践行社会主义核心价值观，努力培养具有国际视野、通晓国际规则、能够参与国际竞争的复合型、创新型人才。

福建农林大学金山学院是2006年国家教育部批准成立的全日制本科层次独立学院,地处具有2200多年悠久历史的文化名城——福建省福州市，坐落于风景秀丽的闽江与乌龙江之间，占地面积720亩，建筑面积约24万平方米，校园内鸟语花香、生机盎然，环境优雅，设施完备。

办学60多年的交通与土木工程学院现设有森林工程、土木工程、交通运输类、工程管理、物流工程5个本科专业，全日制在校本科生人数达1300多人；拥有1个林业工程博士后科研流动站，1个森林工程二级学科博士学位授权点和省级特色重点学科；有交通运输工程、林业工程2个一级学科硕士学位授权点和交通运输工程1个省级重点学科，有交通运输工程、林业工程和建筑与土木工程3个工程领域专业硕士学位授权点，硕博士在校生150多人。